超声成像肠道炎症:工程化益生菌生物传感器实现无创诊断新突破

【字体: 时间:2025年08月26日 来源:Nature Communications 15.7

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  本研究针对炎症性肠病(IBD)诊断的侵入性难题,开发了基于大肠杆菌Nissle 1917(EcN)的超声响应型益生菌生物传感器。通过优化双组分系统(TCS)和重组酶开关,实现了对硫代硫酸盐(S2O32-)/连四硫酸盐(S4O62-)的灵敏检测,并在抗生素诱导的小鼠肠道炎症模型中验证了超声成像可行性。该技术为IBD的无创动态监测提供了新工具。

  

肠道炎症的无创成像困境与突破

炎症性肠病(IBD)影响着全球数百万人群,其诊断长期依赖结肠镜等侵入性检查,不仅给患者带来痛苦,还可能导致治疗延迟。虽然现有工程菌能通过荧光报告炎症标志物,但光信号的组织穿透力限制使其难以实现体内成像。这项发表于《Nature Communications》的研究另辟蹊径,将超声成像与合成生物学结合,开创了"诊断酸奶"新范式。

关键技术方法

研究团队通过三步策略实现突破:(1)优化双组分系统(TCS)的硫代硫酸盐/连四硫酸盐感应通路,将报告基因替换为声学报告基因(ARG);(2)引入Bxb1重组酶开关放大信号,利用温度敏感元件控制泄漏表达;(3)建立链霉素诱导的小鼠肠道炎症模型,通过离子色谱-质谱(IC-MS)验证生物标志物水平,结合定制化BURST*超声成像系统实现体内监测。

工程化生物传感器的设计与优化

研究人员首先改造临床级益生菌EcN,使其表达来自Serratia sp.的bARGser基因,编码能散射超声波的气体囊泡(GVs)。通过易错PCR和启动子工程,获得thsS(t3)突变体,使传感器在37℃下的响应强度提升10.5倍。引入Bxb1重组酶开关后,信号放大达51倍,检测限降至57.2μM,成功区分"翻转"与"未翻转"细胞群体。

体内验证与疾病模型建立

在链霉素处理的小鼠中,工程菌定植3天后仍保持稳定表达。超声成像显示炎症组盲肠区域信号显著增强,与粪便流式细胞术检测的GFP阳性率(19.2倍升高)高度一致。组织病理学证实链霉素会引起单核细胞浸润等典型炎症特征,IC-MS显示粪便硫代硫酸盐浓度达90μM,是氯霉素对照组的3倍。

技术普适性与机制探索

研究拓展至哌拉西林诱导模型,证实不同抗生素均可通过扰乱菌群触发炎症。值得注意的是,链霉素中的硫酸盐通过促进硫酸盐还原菌(SRB)增殖,间接增加硫代硫酸盐生成。该发现不仅验证了生物传感器的可靠性,还揭示了抗生素诱导炎症的新机制。

结论与展望

这项研究首次实现工程菌的超声成像,其价值体现在三方面:(1)诊断层面,将结肠镜检查转化为"喝酸奶+做B超"的便捷流程;(2)技术层面,建立TCS-重组酶-ARG的模块化设计框架;(3)科学层面,阐明硫代谢在抗生素相关肠炎中的作用。未来通过优化菌株定植策略(如代谢驯化)和成像算法,该技术有望拓展至更多胃肠道疾病的动态监测。

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