哥伦比亚甘蔗根系中分离的阿根廷固氮螺菌Ap18和甘蔗葡糖酸杆菌Ap92基因组草图解析

来自哥伦比亚的研究团队针对植物微生物组促进作物生长的关键机制，完成了两种甘蔗根际促生菌——阿根廷固氮螺菌(Azospirillum argentinense) Ap18和甘蔗葡糖酸杆菌(Gluconacetobacter sacchari) Ap92的基因组测序。研究采用Illumina NovaSeq X Plus平台获得高质量基因组数据（Ap18：7.41 Mb，65×覆盖度；Ap92：4.48 Mb，92×覆盖度），通过SPAdes组装和PGAP注释揭示其携带大量植物促生相关基因，dDDH分析证实菌株分类地位。该成果为开发新型微生物肥料奠定分子基础。

　　

在哥伦比亚考卡河谷的甘蔗根系中，科研人员成功分离出两株具有植物促生潜力的细菌——阿根廷固氮螺菌(Azospirillum argentinense) Ap18和甘蔗葡糖酸杆菌(Gluconacetobacter sacchari) Ap92。通过冷冻保存菌株复活后，研究团队采用高通量测序技术绘制了它们的基因组图谱：Ap18基因组大小7,412,287 bp（GC含量68.5%），包含6,695个预测基因；Ap92基因组4,484,949 bp（GC含量66.0%），含4,199个编码基因。

实验过程中，研究人员运用NEBNext Ultra II FS建库试剂盒制备文库，在Illumina NovaSeq X Plus平台上获得2×150 bp双端测序数据。经过Trimmomatic质控和SPAdes组装后，使用rhodospirillales_odb10数据库评估显示基因组完整性超过99%。特别值得注意的是，通过全基因组比对发现Ap18与模式菌株Az39^T的DNA-DNA杂交相似度(dDDH)达86.6%，而Ap92与标准菌株LMG 19747^T的相似度更高达92.4%。

这些携带大量功能基因（如固氮、植物激素合成相关基因）的微生物基因组数据，为解析植物-微生物互作机制提供了重要线索。研究采用的CheckM评估体系显示基因组污染率低于10%，BUSCO分析确认其完整性超过91%，确保数据的可靠性。该成果不仅丰富了根际微生物资源库，更为开发基于微生物组学的精准农业技术提供了分子靶点。