越南健康人源益生菌枯草芽孢杆菌Eramic25的基因组特征与安全评价

来自越南的研究团队对健康成人粪便分离的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)Eramic25进行全基因组测序分析，通过Illumina MiSeq平台获得3.85 Mb基因组草图（GC含量43.53%），经RAST注释发现4247个蛋白编码基因。MLST分型确定为ST123型，系统发育分析显示其与生物膜形成菌株RI491高度同源。关键发现包括：KEGG富集显示次级代谢产物合成、辅因子生成等益生相关通路，且通过ABRicate筛查确认不含bceT、hblABC等毒力基因，为开发功能性食品提供安全菌株资源。

　　

这份研究报告揭示了一株具有应用潜力的益生菌——从越南健康志愿者粪便中分离的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)Eramic25。该革兰氏阳性、产芽孢的细菌通过80°C热处理筛选获得，经MALDI-TOF MS质谱鉴定后，采用Illumina MiSeq平台进行双端测序(2×75 bp)，获得100×覆盖度的基因组数据。

基因组组装显示其大小为3,855,385 bp，包含100个contig，N50达95,906 bp。有趣的是，注释发现该菌株携带4个rRNA、33个tRNA和1个tmRNA，尤其富含次级代谢产物合成和氨基酸代谢相关基因。通过构建最大似然系统发育树发现，Eramic25与已知的生物膜形成菌株RI491(CP051306.1)亲缘最近。

安全性评估是本研究亮点：利用ABRicate筛查证实该菌株不含肠毒素基因bceT、溶血素hblABC等危险因子。KEGG分析进一步显示其显著富集于双组分调控系统等益生功能通路，而毒力通路完全缺失。这些发现为开发改善肠道菌群、增强免疫的功能性食品提供了分子基础。

值得注意的是，该菌株经多基因位点序列分型(MLST)确定为ST123型，其7个看家基因(glpF、ilvD等)与参考菌株100%匹配。研究团队采用Roary进行泛基因组分析，用MAFFT比对核心基因，最终通过FastTree构建的进化树直观展示了Eramic25的进化地位。这些数据为理解益生菌的基因组特征与安全性建立了重要参考。