黄曲霉(Aspergillus melleus)CBS 546.65基因组注释揭示其生物合成潜力及工业应用价值

来自美国加州大学河滨分校的研究团队对工业重要真菌黄曲霉(Aspergillus melleus)CBS 546.65进行全基因组注释，鉴定出12,841个蛋白质编码基因和102个生物合成基因簇(BGCs)，包括30个I型聚酮合酶(PKS)和21个非核糖体肽合成酶(NRPS)，为开发新型杀虫剂、营养保健品及抗生素提供了重要遗传资源。

　　

这株编号CBS 546.65的黄曲霉(Aspergillus melleus)可不简单——它不仅是能生产杀虫剂aspyrone¹和mellamide²的生化工厂，还能合成赭曲霉毒素A^3,4和抗生素⁵，其分泌的蛋白酶更被开发成增强免疫力的营养补充剂^6-8。研究人员采用Funannotate v1.8.9流程，通过PacBio和Illumina混合组装技术，结合RNA-seq数据与同源蛋白比对，最终绘制出这张精细的基因蓝图。

基因组重复序列先用RepeatModeler v2.0.1构建了专属的转座子数据库，再经RepeatMasker过滤。通过Trinity-GG v2.11.0组装的33,620条转录本，为Augustus等基因预测软件提供了训练数据。经过Evidence Modeler整合优化，最终获得包含13,061个基因（含213个tRNA）的注释结果，其中256个基因存在可变剪切。

最令人振奋的是antiSMASH v5.2.0预测的102个生物合成基因簇：30个I型聚酮合酶(PKS)如同分子装配线，21个非核糖体肽合成酶(NRPS)好比乐高大师，还有15个萜烯合成酶和6个吲哚合成酶。这些隐藏在DNA序列中的化学密码，未来或可解锁出更多新型生物活性分子。

研究获得美国农业部NIFA、NSF等多方资助，数据在配备NIH专项设备的加州大学高性能计算集群完成分析。这项发表于《微生物资源通报》的成果，为挖掘真菌次级代谢产物开辟了新路径。