
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
新型卡托普利衍生的广谱金属β-内酰胺酶抑制剂:可持续Joullié-Ugi反应与连续流技术的创新应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月27日 来源:Journal of Medical Mycology 2.2
编辑推荐:
为解决临床亟需的金属β-内酰胺酶(MBL)抑制剂短缺问题,意大利那不勒斯费德里科二世大学团队通过可持续Joullié-Ugi多组分反应和连续流技术,设计出基于吲哚啉骨架的新型MBL抑制剂。该研究通过生化实验和分子对接证实化合物对NDM-1、VIM等5种临床相关MBL亚型具有纳摩尔级抑制活性,其中6d可协同亚胺培南使耐药菌MIC降低8倍,且完全规避ACE-1抑制副作用,为抗耐药菌药物开发提供新策略。
随着"超级细菌"的全球蔓延,碳青霉烯类抗生素——这道人类对抗革兰阴性菌感染的最后防线正在崩塌。罪魁祸首是细菌携带的金属β-内酰胺酶(MBL),这类酶能水解几乎所有β-内酰胺类抗生素,包括救命用的碳青霉烯类药物。更严峻的是,MBL基因可通过质粒在菌株间快速传播,导致NDM-1、VIM等亚型在临床菌株中广泛流行。尽管全球科学家努力数十年,至今仍未有任何MBL抑制剂获批上市,而COVID-19疫情期间抗生素的滥用更使这场"无声疫情"雪上加霜。
在这生死时速的竞赛中,降压药卡托普利意外带来曙光——其分子结构中的巯基能弱效抑制MBL。受此启发,意大利那不勒斯费德里科二世大学Margherita Brindisi团队在《Journal of Medical Mycology》发表研究,通过创新药物设计策略,将卡托普利结构嵌入吲哚啉骨架,开发出新一代广谱MBL抑制剂。研究巧妙融合可持续化学与合成生物学技术,采用Joullié-Ugi多组分反应实现"一锅法"高效构建分子骨架,并通过连续流技术将反应时间从12小时缩短至75分钟。
关键技术包括:1)基于NDM-1晶体结构的理性设计,保留锌离子结合域并增强疏水相互作用;2)建立包含5种MBL亚型(NDM-1/VIM-1/VIM-2/IMP-1/IMP-7)的酶活性检测体系;3)采用临床分离的10株MBL阳性菌株评估协同效应;4)结合圆二色谱(CD)和TDDFT计算确证绝对构型;5)通过500ns分子动力学模拟解析结合模式。
2.1 理性设计
研究团队通过分析卡托普利与NDM-1的共晶结构(PDB:4EXS),发现其D-异构体抑制活性(Ki=1.3μM)显著优于L-异构体。据此设计两个系列化合物:系列1将卡托普利脯氨酸环改造为3,3-二甲基/二乙基/螺环己基取代的吲哚啉骨架,羧基替换为酰胺以降低ACE-1抑制;系列2则嵌入硫奥芬的甘氨酰胺结构。分子对接预测新化合物可通过巯基螯合锌离子,并通过吲哚环与Trp87形成π-π堆积。
2.2 合成创新
突破性采用"中断Fischer吲哚化-Joullié-Ugi反应"的级联策略,以三苯甲基异腈或乙氧羰基甲基异腈为关键组分,实现克级规模制备。通过优化反应条件(2h碱性水解),成功避免2位手性中心差向异构化问题。CD光谱结合理论计算证实(S,S')-14b的绝对构型,为后续构效关系研究奠定基础。
2.3 生物活性
荧光底物法显示化合物6d对VIM-2抑制活性最强(Kd=80nM),较D-卡托普利提升27倍。动力学分析揭示其通过慢结合机制(k+2/K=1.2×104 M-1s-1)形成稳定复合物。值得注意的是,6d对NDM-1(Ki=2.6μM)和IMP-1(Ki=3.8μM)也保持广谱抑制,且50μM浓度下对ACE-1抑制率<5%,完全规避原药副作用。在VIM-1阳性肺炎克雷伯菌(T2216)中,128μg/mL 6d可使亚胺培南MIC从4μg/mL降至2μg/mL,生长曲线显示抑菌效果延长6小时。
3. 结论与展望
该研究通过"老药新用"策略,创制出首个兼具广谱MBL抑制和革兰阴性菌穿透活性的吲哚啉类先导化合物。分子动力学模拟揭示其独特作用机制:除锌离子螯合外,吲哚环与L3环(Met67/Phe70/Trp93)的疏水口袋相互作用是广谱活性的关键。尽管当前化合物在部分菌株中渗透性仍需优化,但建立的连续流合成平台(收率提升15%)为快速衍生化提供可能。这项工作为应对WHO列为"关键优先病原体"的碳青霉烯耐药菌提供了创新解决方案,其"结构简化+功能强化"的设计思路对其它金属酶抑制剂开发具有重要借鉴意义。
生物通微信公众号
知名企业招聘