从石莼中分离的Aliiglaciecola新种SL4基因组测序揭示其降解复杂多糖的代谢潜能

来自新西兰的研究团队针对高价值藻类石莼(Ulva sp.)的共生关系展开研究，分离获得一株具有利用石莼多糖(ulvan)能力的附生细菌Aliiglaciecola sp. nov. SL4。通过Illumina测序获得4.4 Mb基因组，注释显示其携带复杂多糖降解基因，为揭示海洋藻类-微生物互作机制提供新线索。

　　

在遍布全球海岸线的石莼(Ulva sp.)表面，科学家们发现了一株神秘的细菌伙伴。这株编号SL4（意为"海莴苣4号"）的细菌展现出惊人的能力——能以石莼细胞壁主要成分石莼多糖(ulvan)作为唯一碳源茁壮成长。

通过精密的全基因组测序技术，研究团队揭开了它的神秘面纱。测序数据显示这株4.4 Mb大小的细菌属于耐冷菌属Aliiglaciecola（意为"冰的其他居民"），与从美国马萨诸塞州海岸分离的Aliiglaciecola lipolytica菌株具有82.52%的平均核苷酸相似性。

更令人兴奋的是，基因组中隐藏着复杂的多糖降解"工具包"。40个contig组成的基因组中，注释到3,793个编码序列，其中包括可能参与藻类细胞壁降解的特殊酶系。这些发现为理解海洋生态系统中藻类与微生物的"分子对话"提供了新视角。

研究团队采用严谨的实验方法：从新西兰陶朗加库林公园海岸无菌采集石莼样本，经过10周海洋培养基富集培养，通过反复平板划线获得纯培养。Illumina NextSeq 2000平台产生的866,049条读长，经Unicycler软件组装后获得N₅₀达361,374 bp的高质量基因组。

这项发现不仅拓展了我们对Aliiglaciecola属代谢能力的认知，更为开发藻类生物质的微生物转化技术提供了候选菌株。特别是该菌株携带的独特多糖降解系统，可能蕴含着尚未被发掘的酶学宝藏。