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基于4D快速DIA乳酸化定量蛋白质组学构建前列腺癌乳酸化风险模型及KCNMA1抑癌机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月29日 来源:Journal of Translational Medicine 7.5
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本研究针对前列腺癌(PCa)预后预测难题,通过4D快速DIA乳酸化(LA)定量蛋白质组学技术筛选关键修饰蛋白,首次构建包含KCNMA1等9个基因的乳酸化风险模型。研究发现KCNMA1通过抑制RAS/RAF/MEK/ERK信号通路促进M1巨噬细胞浸润,显著抑制PCa进展。该成果发表于《Journal of Translational Medicine》,为PCa诊疗提供了新型预后工具和靶向治疗策略。
前列腺癌作为男性第二大常见恶性肿瘤,每年导致全球37.5万人死亡,其治疗面临严峻挑战。虽然内分泌治疗对早期患者效果显著,但约30%病例会进展为去势抵抗性前列腺癌(CRPC),此时传统疗法收效甚微。近年来,乳酸化修饰(LA)作为新型表观遗传调控机制备受关注,它通过将乳酸共价结合至组蛋白和非组蛋白的赖氨酸残基,参与肿瘤代谢重编程和免疫微环境调控。然而,LA在前列腺癌中的全局特征及其临床意义仍属空白,这正是Fan Zou和Yongchen Jin团队开展此项研究的出发点。
研究团队创新性地采用4D快速数据非依赖采集(DIA)乳酸化定量蛋白质组学技术,对北京同仁医院5例PCa患者的癌组织和癌旁样本进行全景分析。通过整合TCGA和GEO数据库835例患者数据,结合机器学习算法构建预后模型,并利用多组学分析和功能实验揭示核心靶点的作用机制。关键技术包括:4D DIA乳酸化定量蛋白质组学(北京同仁医院临床样本)、共识聚类分析(TCGA和GEO数据库)、LASSO-Cox回归建模、免疫浸润评估(CIBERSORT算法)、以及体内外功能验证(包括裸鼠成瘤实验和Transwell共培养体系)。
研究结果首先通过"Expression and prognosis analysis"揭示:蛋白质组学鉴定出811个差异蛋白(335个上调如HPN,476个下调如S100P),乳酸化修饰主要富集于胶原组织调控和TLR信号通路。基于19个LA核心基因将患者分为预后显著差异的Cluster A/B两型(p=0.001),其中Cluster B呈现更强的免疫细胞浸润和代谢异常特征。
"Function experiment"部分证实:构建的9基因风险模型(含KCNMA1、C1QTNF1等)在TCGA和GEO队列中均显示优异预测效能(训练组p<0.001,测试组p=0.025)。特别值得注意的是,钾通道基因KCNMA1在PCa组织中表达显著低于癌旁(p<0.01),且与Gleason评分呈负相关。体外实验显示KCNMA1过表达使PC3和DU145细胞增殖率下降40%(CCK-8检测),迁移能力降低2.3倍(Transwell实验)。
"Mechanism exploration"深入阐释:KCNMA1通过直接结合RAF蛋白抑制MAPK通路关键节点(RAS/RAF/MEK/ERK磷酸化水平降低60%),同时促进M1巨噬细胞趋化因子分泌(共培养实验显示迁移细胞数增加1.8倍)。动物实验进一步验证,KCNMA1过表达使肿瘤体积缩小57%(p<0.01),免疫组化显示CD80+ M1巨噬细胞浸润增加3.2倍。
这项发表于《Journal of Translational Medicine》的研究具有三重突破性价值:首先,创建了首个前列腺癌乳酸化修饰预后预测模型,临床转化潜力显著;其次,发现KCNMA1是新型抑癌基因,其通过"代谢-表观遗传-免疫"三重调控机制抑制肿瘤进展;最后,阐明LA修饰与MAPK通路交互作用,为克服CRPC治疗抵抗提供新思路。值得注意的是,该研究也存在样本量有限(5例蛋白质组学数据)和KCNMA1功能争议(与Bloch等报道的促癌作用相左)等局限,这些正是未来多中心研究需要重点突破的方向。
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