基于全基因组重测序(WGR)和SNP标记开发的穿心莲种子萌发率遗传解析及育种改良

来自亚洲的研究人员针对传统药用植物穿心莲(Andrographis paniculata)种子萌发率低的育种难题，通过全基因组重测序(WGR)和数量性状位点测序(QTL-seq)技术，在40份种质中鉴定出24个与萌发相关的SNP位点，并开发出3个预测准确率达71.43%的分子标记（1-5362280等），为穿心莲分子标记辅助选择(MAS)育种提供了关键技术支撑。

　　

这项突破性研究揭示了穿心莲(Andrographis paniculata)种子萌发率的遗传奥秘。通过对40份种质资源的萌发测试，发现存在显著两极分化：33份材料萌发率仅0-20%，而7份优异种质可达81-100%。研究团队运用全基因组重测序(WGR)技术对23份代表性样本进行深度解析，结合群体遗传结构和数量性状位点(QTL-seq)分析，在5条染色体上精确定位了24个与萌发相关的单核苷酸多态性(SNP)位点。

创新性地采用四引物ARMS-PCR技术开发出5个实用型SNP标记，其中1-5362280、1-5679230和16-3668893三个标记与高萌发率表型高度吻合。特别值得注意的是，1-5362280标记展现出71.43%的预测准确率，犹如给穿心莲育种装上了"基因导航仪"。这些分子标记的开发为穿心莲分子标记辅助选择(MAS)育种提供了关键技术工具，将显著加速优质高产品种的选育进程，对实现这一传统药用植物的现代化高效栽培具有重要实践价值。