西伯利亚鲟TRAF基因家族成员鉴定及分子特征解析揭示其在先天免疫中的关键作用

【字体: 时间:2025年08月29日 来源:Fish & Shellfish Immunology 3.9

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  (编辑推荐)本研究通过基因组-转录组联合分析,首次在西伯利亚鲟(Acipenser baerii)中鉴定出TRAF(肿瘤坏死因子受体相关因子)家族成员Abtraf1/5/6/7,揭示其结构保守性及组织特异性表达模式。研究发现Abtraf对细菌(如无乳链球菌、嗜水气单胞菌)和病毒模拟物poly(I:C)具有差异化响应,其中Abtraf5偏好细菌成分(LPS/PGN),而Abtraf7特异性响应poly(I:C),为硬骨鱼TRAF介导的PRRs(模式识别受体)-NF-κB/JAK-STAT通路机制提供了新证据。

  

Highlight

西伯利亚鲟TRAF基因家族的系统鉴定与功能解析

Identification of TRAF in sturgeon

通过比较基因组学分析,研究者以鲟形目物种(如小体鲟Acipenser ruthenus、匙吻鲟Polyodon spathula)基因组为参考,结合转录组数据在西伯利亚鲟中鉴定出4个TRAF家族成员:Abtraf1、Abtraf5、Abtraf6和Abtraf7。系统发育分析显示这些基因在硬骨鱼中具有高度序列保守性,其编码蛋白含有典型的N端RING指结构域、锌指结构域和C端TRAF结构域(TRAF7例外,含WD40重复序列)。

Discussion

TRAF家族作为TLRs(Toll样受体)、NLRs(NOD样受体)和RLRs(RIG-I样受体)信号通路的关键适配蛋白,通过调控NF-κB和JAK-STAT通路参与免疫防御。本研究发现:

  1. 1.

    Abtraf在鲟鱼早期发育阶段(pre-larvae)和免疫组织(头肾、鳃、脾脏)高表达

  2. 2.

    病原体刺激后,Abtraf5对细菌组分LPS/PGN响应强烈,而Abtraf7独特性响应病毒模拟物poly(I:C)

  3. 3.

    鲟鱼特异性全基因组复制事件可能导致TRAF家族成员的功能分化

Conclusion

该研究首次绘制了西伯利亚鲟TRAF家族的免疫调控图谱,揭示其在病原体防御中的"分工协作"机制——Abtraf5如同"细菌哨兵"专攻细菌识别,而Abtraf7则化身"病毒雷达"特异性响应病毒侵袭,为鲟鱼疾病防控策略提供了分子靶点。

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