产KPC和mcr耐药基因的阴沟肠杆菌复合体分子流行病学及基因组特征：耐药基因传播的临床启示

《International Journal of Antimicrobial Agents》：Molecular Epidemiology and Genomic Insights into Enterobacter cloacae Complex Co-Harboring bla KPC and mcr: Implications for Resistance Gene Transmission

本文系统研究了全球范围内同时携带碳青霉烯酶基因blaKPC和多粘菌素耐药基因mcr的阴沟肠杆菌复合体（ECC）的分子流行病学特征，通过全基因组测序和质粒分析揭示了IncHI2(2A)质粒介导的双重耐药基因水平传播机制，为临床监测"超级耐药菌"和"超级质粒"提供了重要理论依据。

　　

Highlight

本研究聚焦同时携带bla_KPC和mcr耐药基因的阴沟肠杆菌复合体（ECC），通过基因组学手段揭示其传播机制。

Source of complete genomes of strains

从NCBI病原体数据库（检索日期：2024年7月22日）筛选获得281株同时携带bla_KPC和mcr的ECC全基因组序列，采用Python脚本进行批量下载。

Strain identification and multilocus sequence typing

使用FastANI v1.31计算平均核苷酸相似性（ANI），结合多位点序列分型（MLST）对菌株进行精确鉴定。

Characteristics of clinical ECC isolates

在281株ECC中，临床分离株占92.17%（n=259），其中65.83%为霍氏肠杆菌（E. hormaechei）。主要流行基因型组合为bla_KPC-3+mcr-9.1，其次为bla_KPC-4+mcr-9.1。

Discussion

碳青霉烯类抗生素和多粘菌素是治疗多重耐药菌感染的最后防线。研究发现携带bla_KPC-mcr-9-IncHI2(2A)质粒的ECC菌株具有高度传播风险，这类"超级质粒"可能通过获得bla_KPC基因进化而来。

Conclusion

ECC已成为bla_KPC和mcr-9的重要储存库，IncHI2(2A)质粒是碳青霉烯和多粘菌素耐药基因共传播的关键载体，需加强临床监测。