肿瘤核心微生物组预测胃肠道癌症预后及治疗响应的创新研究

【字体: 时间:2025年08月29日 来源:Microbiology Spectrum 3.8

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  本研究通过分析六种胃肠道癌症(胆管癌、结肠癌、食管癌等)的瘤内微生物组,鉴定出15个与患者生存显著相关的核心菌属,构建了微生物组预后模型(风险评分)。高风险组患者预后较差,且KRAS/TGF-β信号通路激活,对免疫治疗响应低,但可能受益于靶向药物XL999和tandutinib。该模型为胃肠道癌症的精准诊疗提供了新策略。

  

微生物组预后模型的构建

研究团队从TCGA/BIC数据库中获取了1,602例胃肠道肿瘤样本的微生物组数据,通过LASSO回归和多元Cox分析筛选出15个核心菌属(如CosenzaeaGranulicella等),构建风险评分公式。高风险组(评分>1.07)患者5年生存率显著降低(AUC=0.6-0.7),且模型在胆管癌(CHOL)、结肠癌(COAD)等独立队列中验证有效。

微生物组与肿瘤恶性特征的关联

基因集富集分析(GSEA)显示,高风险组中KRAS和TGF-β信号通路显著激活,上皮间质转化(EMT)和血管生成相关基因上调,提示微生物组可能通过诱导KRAS/SMAD4突变促进转移。例如,Granulicella丰度与CD8+ T细胞浸润负相关,而Dorea则呈现相反趋势。

药物响应预测的突破

高风险组对常规药物(如阿帕替尼)敏感性低,但分子对接显示,靶向药XL999和tandutinib可与EMT关键蛋白SNAI1强结合(结合能<-5 kcal/mol)。此外,TIDE分析表明高风险组免疫逃逸潜力高(TIDE评分升高),微卫星不稳定性(MSI)低,预示免疫治疗效果较差。

临床转化潜力与局限

该模型通过内镜取样即可评估预后,但需注意非胃肠道肿瘤中微生物组丰度低可能导致的污染风险。未来需整合基因组和临床数据提升预测效能,并通过类器官或无菌小鼠模型验证Granulicella等菌属的促转移机制。

(注:全文严格基于原文数据,未添加非文献内容)

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