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单细胞转录组与微阵列整合分析揭示小鼠精原干细胞中Kit与Nmyc的协同调控机制及其在精子发生中的关键作用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月30日 来源:Frontiers in Cell and Developmental Biology 4.3
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本研究通过CD49f-MACS分选和基质选择技术分离小鼠精原干细胞(SSCs),结合微阵列、单细胞RNA测序(scRNA-seq)和蛋白质互作网络(PPI)分析,系统揭示了Kit受体与Nmyc基因在SSCs分化中的核心调控作用。研究发现Kit通过视黄酸(RA)信号通路驱动精原细胞分化,并与多能性基因Nanog、Dazl、Pou5f1(Oct4)形成共表达网络,为男性不育治疗提供了新靶点。研究还利用加权基因共表达分析(WGCNA)和功能富集技术解析了干细胞维持相关通路(如Wnt、PI3K/AKT)。
通过CD49f-MACS和胶原非结合/层粘连蛋白结合基质筛选技术,研究者从7周龄C57BL/6小鼠睾丸中分离出精原干细胞(SSCs)。免疫细胞化学检测显示,筛选后的细胞高表达Dazl、Pou5f1(Oct4)、Gfra1和Nanog等标志物,证实其未分化特性。电子显微镜观察发现,这些细胞直径约6-12 μm,核质比高,呈典型球形,并通过细胞间桥形成链状或簇状结构。值得注意的是,培养体系中较大的卵圆形细胞(12-14 μm)可能代表分化中的精原细胞。
通过STRING数据库构建的蛋白质互作网络包含50个节点和236条边,其中Kit(红色节点)与Nmyc、Nanog等核心干细胞因子显著关联。子网络分析揭示Kit与Nmyc存在126个共同互作蛋白,主要富集于胚胎发育(GO:0009790)、干细胞群体维持(GO:0019827)等生物学过程。KEGG通路分析显示,这些基因显著参与干细胞多能性调控网络,包括Wnt信号和PI3K-AKT通路。组织定位分析进一步表明,靶基因在胚胎干细胞、胚泡和精原细胞中活跃表达。
WGCNA分析鉴定出5个功能模块,其中棕色模块与正常睾丸组织相关性最高(r=0.68,p=8×10-51)。差异表达基因(DEGs)分析发现,Kit相关基因在分化精原细胞中显著上调,与RA信号激活同步。单细胞转录组数据(GSE211115)显示,Kit在新生儿睾丸中的表达量较胚胎期降低,但在分化精原细胞(diff SPG)中仍保持高水平,而Nmyc则在未分化精原细胞(Undiff SPG)中特异性高表达。Fluidigm微流控qPCR证实,随着传代次数增加,Nanog表达上升而Kit表达下降,提示培养条件影响干细胞状态。
基因共表达分析揭示Kit与Nmyc(R=0.91)、Dazl(R=0.89)、Nanog(R=0.85)和Pou5f1(R=0.82)存在强正相关。配体-受体互作分析发现,Kitl(由支持细胞分泌)通过激活Kit受体调控四条下游通路:1)PI3K/AKT通路促进细胞存活;2)SRC家族激酶调控细胞迁移;3)PLCG通路重启减数分裂;4)MAPK级联反应介导基因转录。值得注意的是,组成型激活Kit突变小鼠表现为圆形精子向长形精子转化障碍,证实其在减数分裂后期的关键作用。
该研究首次整合微阵列、scRNA-seq和PPI网络,阐明Kit-Nmyc轴通过RA信号协调精原细胞命运决定的分子机制。近期研究补充发现,CHD4通过调控Kit翻译抑制维持SSCs干性,而3D类器官培养体系可更好地模拟体内微环境。未来需结合基因编辑(如CRISPR-Cas9)和移植实验验证这些靶点的治疗潜力,特别是在非梗阻性无精症中的应用。多组学技术的融合(如scATAC-seq与空间转录组)将有助于解析SSCs异质性,推动体外配子发生技术的发展。
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