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中国西南地区儿童Alport综合征的分子诊断:靶向外显子测序揭示新型COL4A3/4/5变异
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月30日 来源:Frontiers in Genetics 2.8
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这篇研究通过靶向外显子测序(TES)对中国西南地区20例临床疑似Alport综合征(AS)患儿进行分子诊断,鉴定出21个COL4A3/4/5基因变异(含10个新发变异),其中76.2%为致病/可能致病性变异。研究证实TES可作为AS早期诊断的高效工具,为遗传咨询及精准治疗提供依据,并拓展了AS相关基因的突变谱。
背景
Alport综合征(AS)是一种由IV型胶原基底膜缺陷引发的遗传性疾病,以血尿、进行性肾功能衰竭为核心表现,常伴高频感音神经性耳聋及眼部异常。其致病基因包括COL4A3、COL4A4(常染色体遗传)和COL4A5(X连锁遗传),三者编码的α3/α4/α5链构成肾小球基底膜(GBM)的关键支架结构。AS的临床异质性高,传统诊断依赖肾活检和免疫荧光染色,但存在侵入性和漏诊风险。
方法
研究纳入20例西南地区疑似AS患儿(中位年龄6.5岁),通过靶向捕获504个肾病相关基因(含COL4A3/4/5)进行外显子测序。采用Illumina平台生成150bp双端读长,数据经BWA-MEM比对和GATK变异检测,严格遵循ACMG标准进行变异分类。新发变异通过Sanger测序验证家系共分离。
结果
共检出21个变异(10个新发),包括错义(47.6%)、移码(23.8%)和剪接变异(9.5%)。76.2%变异被判定为致病/可能致病,其中COL4A5占比最高(6/10新变异)。表型分析显示所有患儿存在血尿,65%伴蛋白尿,仅5%出现听力或视力异常。值得注意的是,男性X连锁AS患者临床表现更严重,符合IV型胶原缺陷的剂量效应理论。
讨论
研究揭示了AS基因型-表型关联的复杂性:COL4A5截短变异多导致重型肾病,而错义变异表型异质性更大。与HGMD数据库对比,新发现的剪接变异c.1033-1G>C和移码变异c.1951_1954dup进一步丰富了东亚人群AS突变谱。靶向测序相比全外显子测序(WES)在成本效益和数据解析效率上更具优势,尤其适合多外显子基因的临床检测。
结论
该研究证实靶向外显子测序是儿童AS分子诊断的可靠方案,为早期干预和家系遗传咨询提供关键依据。未来需扩大样本验证新变异的致病机制,并探索基因治疗在AS中的应用潜力。