高加索三叶草基因组测序及SSR标记开发：为牧草遗传研究提供新工具

来自国内的研究人员针对高加索三叶草(Trifolium ambiguum)遗传信息缺失的问题，通过新一代测序技术开展全基因组调查。研究首次估算该物种基因组达4.36 Gb，开发546,107个SSR位点并验证20个高多态性标记(PIC=0.56)，为后续基因组组装和牧草育种奠定基础。

　　

高加索三叶草(Trifolium ambiguum Bieb.)作为一种兼具环境适应性和营养价值的多年生豆科牧草，其遗传密码长期未被破译。科研团队运用新一代测序技术(NGS)展开全基因组探索，通过K-mer分析揭示该物种基因组达4.36 Gb的庞大体量，同时测得0.44%的杂合率和惊人的94.41%重复序列占比。

基于海量基因组数据，研究者系统开发出546,107个简单序列重复(SSR)标记位点，其中单核苷酸重复(62.0%)占据主导地位，二核苷酸(18.8%)和三核苷酸(6.8%)紧随其后。从这些标记中精选120对SSR引物进行验证，最终20个高多态性标记在12个种质资源中成功扩增出93个等位基因，平均多态性信息含量(PIC)达0.56，展现出优异的鉴别能力。

这项研究不仅首次绘制高加索三叶草的基因组特征图谱，更为重要的是建立了首个SSR标记库，为后续全基因组精细组装、分子标记辅助育种以及该珍贵牧草资源的遗传多样性研究提供了关键工具。