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双探针组Hyb-Seq位点分相揭示十字花科Boechera属杂交谱系的系统发育模式
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月30日 来源:Annals of Botany 3.6
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来自北美的研究人员针对十字花科Boechera属复杂的杂交与无融合生殖机制,通过整合Angiosperms353和Brassicaceae特异性双探针组,对7个推测为杂种起源的无融合生殖二倍体样本进行1114个Hyb-Seq位点的分相分析。研究成功将14个分相杂种分支纳入现有系统发育树,验证了微卫星数据推测的杂交关系,为理解植物多样性形成机制提供了新范式。
在十字花科Boechera属这个以杂交和无融合生殖(apomixis)著称的复杂进化体系中,研究者采用创新性的双探针组分相技术揭开了其谱系之谜。该属包含80余种有性繁殖物种,主要分布于北美地区,因其独特的无融合生殖杂交能力成为研究植物克隆繁殖的明星模型。
通过改良的HybPhaser流程,团队对Angiosperms353(广谱开花植物探针)和Brassicaceae特异性探针两组捕获的1114个位点进行分相(phasing)处理,研究对象是7个基于花粉形态和微卫星数据推测的杂种起源无融合生殖二倍体。运用RAxML-NG和wASTRAL构建的系统发育树显示,14个分相后的杂种分支完美嵌入了原有108个有性二倍体的进化框架。
这项概念验证性研究不仅证实了微卫星标记预测的杂交关系,更通过多探针组分相技术绘制出Boechera属网状进化的精细图谱。该成果为理解杂交和无融合生殖如何驱动植物适应性进化提供了关键案例,其技术路线对研究其他复杂植物类群的进化动态具有重要借鉴意义。
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