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基于Pepscan与生物信息学策略的蜱虫多肽疫苗B细胞表位鉴定研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月31日 来源:Molecular and Biochemical Parasitology 1.5
编辑推荐:
【编辑推荐】本研究通过Pepscan体外表位定位结合生物信息学算法优化,首次建立针对蜱虫唾液serpin蛋白(RmS-6/RmS-17)的中和性B细胞表位(BCE)预测体系,为开发靶向蜱虫蛋白酶抑制剂(serpin)反应中心环(RCL)的多肽疫苗提供新策略,显著提升表位预测精准度与成本效益。
Highlight
最佳B细胞表位预测算法
不同B细胞表位(BCE)预测算法的性能比较结果如表1和图1所示,其中灵敏度与阳性预测值(PPV)的关联性显示:纵坐标越高代表算法召回率越强,横坐标越远则预示算法精确度越高。针对RmS-17的Pepscan线性表位结果,ABCpred预测效果最佳(灵敏度100%,PPV 32.66%,马修斯相关系数MCC=0.2299);而构象性表位预测则以CBTOPE表现最优。
讨论
在反向疫苗学(reverse vaccinology)策略中,计算表位定位常被用于筛选抗蜱疫苗新靶点。但现有算法基于人类基因组开发,其对蜱虫抗原表位的预测效能存疑。本研究创新性地利用已知蛋白靶标区域(如serpin RCL)作为参照,显著提升了其他蜱虫蛋白抗原表位的发掘效率。
结论
本研究证实:基于已有蜱虫蛋白表位数据优化B细胞表位预测算法,可高效鉴定新抗原(如RmS-6)的中和性表位。针对预测表位合成的肽段所产生IgG能有效中和RmS-6活性,提示这些肽段可作为多肽疫苗的潜在靶点。未来需通过动物实验进一步验证其保护效力。
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