印度野生白蛉线粒体DNA条形码分子鉴定及其在疾病传播中的系统发育研究

【字体: 时间:2025年08月31日 来源:Scientific Reports 3.9

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  本研究针对印度白蛉形态学鉴定困难的问题,通过COI基因DNA条形码技术对31种10456只白蛉进行分子鉴定,首次报道了Se. africana在印度的分布,构建了包含169条新序列的数据库,系统发育分析证实COI条形码能有效区分物种界限,为白蛉监测和利什曼病防控提供了重要分子工具。

  

在热带和亚热带地区,一种微小但危险的昆虫——白蛉(sand flies)正悄然传播着致命的利什曼病(leishmaniasis)。这种由利什曼原虫(Leishmania spp.)引起的疾病,每年在全球造成约9万例感染,其中印度贡献了18%的病例。更令人担忧的是,传统的白蛉物种鉴定方法正面临严峻挑战:标本易损、形态相似种难以区分、需要专业分类知识等问题,严重制约了疾病防控工作的开展。

针对这一难题,印度医学研究委员会(ICMR)的Harish Kumar Shah、P.A. Fathima等研究人员在《Scientific Reports》发表了一项开创性研究。他们采用DNA条形码技术,对印度6个邦26个地区采集的10456只白蛉进行分子鉴定,旨在建立可靠的物种鉴定方法,为疾病防控提供科学依据。

研究团队主要运用了三种关键技术:野外采集采用机械吸引器和光诱捕法;形态学鉴定依据Kalra和Bang的分类学标准;分子分析则通过COI基因(cytochrome c oxidase subunit I)扩增和测序,使用LCO1490/HCO2198引物进行PCR,最终获得570bp的标准片段用于分析。样本覆盖印度南部、西部、北部、东部和中部多个地区,确保地理代表性。

研究结果

样本采集与形态鉴定

研究历时6年(2018-2024年)共采集10456只白蛉,鉴定为4属31种,包括9种Phlebotomus属、20种Sergentomyia属,以及Grassomyia和Idiophlebotomus属各1种。其中Sergentomyia africana为印度新记录种,发现于拉贾斯坦邦Jodhpur地区的牛棚中。

DNA条形码分析

成功获得169条COI序列(585-711bp),GC含量为34.8%,显示典型的AT富集特征。系统发育分析显示大多数物种形成高支持度的单系群(bootstrap>80%),验证了形态鉴定结果。但发现Se. punjabensis和Gr. indica存在异常聚类,提示可能存在数据库序列错误鉴定。

物种界定分析

三种分析方法得出不同结论:ABGD识别34个组,ASAP支持32个候选种,而bPTP则过度分割为68个群。特别值得注意的是Se. shorttii、Se. insularis和Se. babu babu三个近缘种遗传距离<0.03,显示COI基因在区分这类近缘种时存在局限性。

分类学讨论

研究发现Gr. indica与GenBank中Se. punjabensis序列高度相似,但形态特征差异显著,推测可能是数据库错误。同时,Se. eadithae与Phlebotomus属物种的聚类关系异常,暗示可能需要多基因标记进一步验证其分类地位。

结论与意义

这项研究首次建立了印度白蛉的COI条形码数据库,包含169条新序列,为30个形态种提供了分子证据。系统发育分析证实COI条形码能有效区分大多数白蛉物种,解决了传统形态学鉴定面临的诸多难题。研究发现Se. africana在印度的分布,更新了该国的白蛉区系记录。

研究揭示了分子数据与形态分类间的若干不一致,如Gr. indica的分类地位问题,以及近缘种间低遗传分化现象。这些发现表明白蛉分类系统仍需进一步完善,未来研究需要结合多基因标记和更大样本量来澄清这些分类学疑问。

从公共卫生角度看,这项研究为印度利什曼病防控提供了重要工具。通过建立可靠的分子鉴定方法,可以更准确地识别病媒白蛉物种,评估疾病传播风险,指导精准防控。特别是对主要病媒如Ph. argentipes的分子监测,将直接支持印度消除黑热病(kala-azar)的国家计划。

该研究也存在一定局限,如部分近缘种区分困难,建议未来结合核基因标记(如cytb和EF1a)进行多基因分析。此外,扩大地理采样范围和增加样本量将有助于揭示潜在的地理种群结构。这些后续工作将进一步完善印度白蛉的分子分类系统,为疾病防控提供更坚实的科学基础。

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