中国三级医院碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌中黏菌素耐药性的分子特征及临床意义

这篇研究首次系统揭示了中国中部大型三甲医院碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）中黏菌素耐药（Colr）的分子机制。通过全基因组测序发现，84.3%菌株为ST11型，主要耐药机制为mgrB基因失活（53.7%），而质粒介导的mcr基因仅占1.5%。值得注意的是，48.5%耐药患者无黏菌素用药史，提示存在复杂的选择压力。研究为临床防控高耐药病原体提供了关键分子流行病学数据。

　　

ABSTRACT

黏菌素作为治疗多重耐药肺炎克雷伯菌的最后防线，其耐药性问题日益严峻。本研究对2021-2024年河南地区134株Col^r-CRKP菌株进行全基因组分析，发现ST11-K64克隆（84.3%）占主导地位，全部携带bla_KPC-2碳青霉烯酶基因。耐药机制分析显示，mgrB基因失活（54例插入突变）是主要机制，而pmrA/pmrB突变占32.8%。值得注意的是，48.5%耐药患者无黏菌素暴露史，且22.4%菌株未检出已知耐药决定簇。

INTRODUCTION

肺炎克雷伯菌作为机会性病原体，其碳青霉烯耐药（CRKP）变种被WHO列为关键优先病原体。黏菌素通过靶向脂多糖（LPS）发挥抗菌作用，但耐药性主要通过mcr基因介导的脂质A修饰或染色体突变（如pmrA/pmrB、phoP/phoQ调控系统）产生。中国CRKP菌株中黏菌素耐药率高达43%，但相关分子流行病学研究仍显不足。

MATERIALS AND METHODS

研究收集郑州大学第一附属医院134株临床分离株，采用肉汤微量稀释法测定黏菌素最小抑菌浓度（MIC）。通过Illumina平台进行全基因组测序，使用ResFinder和ISfinder分析耐药基因及插入序列。系统发育树采用RAxML构建，统计检验通过R软件完成。

RESULTS

临床特征显示73.9%菌株来自ICU，主要标本为支气管肺泡灌洗液（34.3%）。药敏试验显示除替加环素外，多数菌株对13种抗生素耐药。基因组分析发现：

1. 1.

   93.2%菌株携带bla_KPC-2，仅2株检出mcr基因（mcr-1.1和mcr-8.2）

2. 2.

   mgrB突变中，ISKpn26（8.9%）和ISKpn14（7.4%）是主要插入序列，首次报道ISRm4-1插入+71位点

3. 3.

   pmrB常见突变为T157P（11.9%）和A246T（10.4%）

4. 4.

   系统发育分型揭示ST11存在K47/K62/K64三种荚膜亚型

DISCUSSION

与欧美不同，中国Col^r-CRKP呈现ST11克隆优势（84.3%），且mgrB失活而非mcr基因为主要机制。IS元件在mgrB的富集可能与碳青霉烯酶质粒的传播相关。近半数无黏菌素用药史的耐药病例，提示环境选择压力或自发突变的重要性。研究局限性包括未评估水平传播风险及部分菌株（如PBR144）的未知耐药机制。

IMPORTANCE

该研究首次揭示中国中部地区CRKP中黏菌素耐药以染色体突变主导的独特模式，为临床抗感染策略提供重要依据。发现新型ISRm4-1插入事件，拓展了对细菌适应性进化的认知。研究强调需加强抗菌药物管理，并开发针对mgrB靶点的新型治疗手段。