迈向原核生物及微真核生物的DNA分类学新纪元:基于分子遗传工具的革新性命名体系

【字体: 时间:2025年09月01日 来源:TRENDS IN Genetics 16.3

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  【编辑推荐】针对现行微生物命名规则难以适应分子遗传学发展需求的问题,研究人员提出向DNA分类学范式转变的创新方案。该研究系统分析了DNA序列作为模式材料(type material)的优劣,制定了物种及高阶分类单元的描述规范,并以核形虫新种Paranuclearia slavaukraini sp. nov.为例,为突破形态学局限、简化国际样本流通(Nagoya protocol)提供了标准化解决方案。

  

在微生物分类学领域,现行命名规则正面临分子遗传学技术突飞猛进带来的严峻挑战。传统依赖形态特征和纯培养的方法,已无法满足新发现微生物(特别是难以培养的类群)的分类需求。研究者们提出革命性的DNA分类学框架,主张将DNA样本、全基因组序列和遗传标记(genetic marker)正式纳入模式标本(type material)体系。

这种创新方法展现出多重优势:突破形态特征的局限性,规避《名古屋议定书》(Nagoya protocol)对生物样本跨境转移的限制,大幅降低模式标本的储存成本。以核形虫纲新物种Paranuclearia slavaukraini sp. nov.(隶属新科Paranucleariidae fam. nov.)为例,研究团队展示了如何通过DNA序列实现精准分类诊断。

DNA分类学不仅简化了分类流程——无需繁琐的形态描述或跨国查阅模式标本,更将推动分子生物多样性监测的标准化进程。研究特别强调,该方法能有效提升序列数据的质量过滤(quality-filtering)、分类归属和功能注释的准确性。为此,研究者们制定了详实的操作指南,并呼吁国际命名法规委员会将DNA模式标本合法化,为微生物分类学开启分子时代的新篇章。

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