乳酸化修饰与吉西他滨耐药性:肝内胆管癌治疗新靶点的整合转录组学分析

【字体: 时间:2025年09月02日 来源:Frontiers in Cell and Developmental Biology 4.3

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  这篇研究通过整合转录组学分析揭示了肝内胆管癌(iCCA)中乳酸化修饰(lactylation)与吉西他滨(gemcitabine)耐药性的关联,鉴定出ITGB4等关键靶点,并发现耐药亚型伴随细胞周期通路激活和免疫逃逸特征(如M2巨噬细胞浸润和CD8+ T细胞减少)。实验验证表明ITGB4敲除可增强化疗敏感性,分子对接筛选出潜在抑制剂。研究为克服iCCA耐药提供了新策略。

  

1 引言

肝内胆管癌(iCCA)作为胆道系统高侵袭性恶性肿瘤,手术切除率仅20%-30%,吉西他滨联合顺铂的一线治疗方案常因耐药失效。近年研究发现,乳酸化修饰通过调控组蛋白(如H4K12)和DNA修复蛋白(如XLF)促进化疗抵抗,但其在iCCA中的作用尚未明确。本研究通过多组学分析揭示乳酸化与耐药关联,并探索靶向干预策略。

2 材料与方法

研究整合GSE116118(耐药细胞系)、GSE244807(246例患者组织)等数据集,通过差异表达分析、WGCNA、机器学习(LASSO/RF/SVM-REF)筛选关键基因。实验部分采用siRNA敲低ITGB4,CCK-8和流式细胞术评估吉西他滨敏感性,AutoDock Vina筛选潜在抑制剂。

3 结果

3.1 耐药相关基因特征

鉴定36个共表达基因(如CDC20、H2AX),富集于染色体分离(p=1.2×10?15)和p53通路。PPI网络显示ITGB4与层粘连蛋白(LAMC2)互作,提示其通过ECM-受体相互作用介导耐药。

3.2 乳酸化与耐药亚型

高耐药评分患者(ssGSEA>0.6)生存期显著缩短(p=0.033),且乳酸化评分与耐药正相关(R=0.72)。GSEA显示该亚型富集DNA复制(NES=2.1)和嘧啶代谢通路。

3.3 免疫微环境重塑

高耐药组M2巨噬细胞浸润增加(p<0.001),CD8+ T细胞减少,免疫检查点CTLA4表达上调,提示免疫抑制微环境促进耐药。

3.4 单细胞解析上皮亚群

单细胞测序发现ITGB4富集于上皮亚群0/2/3,其分化轨迹与耐药基因集(AUC=0.82)、乳酸化评分(AUC=0.79)高度重叠,且激活FAK/VEGF通路。

3.5 靶向ITGB4逆转耐药

siRNA敲低ITGB4使HUCCT1细胞对吉西他滨敏感性提升3.1倍(IC50从2.3 μM降至0.74 μM),凋亡率增加2.4倍(p<0.001)。分子对接发现薯蓣皂苷(Dioscin)与ITGB4结合能达-10.3 kcal/mol,RMSD模拟证实复合物稳定性。

4 讨论

研究首次将乳酸化修饰与iCCA耐药关联,提出ITGB4-PI3K/AKT轴可作为联合治疗靶点。局限性在于未验证乳酸化直接调控机制,未来需构建转基因模型探索表观遗传-代谢交互网络。

5 结论

ITGB4驱动的乳酸化修饰是iCCA吉西他滨耐药的核心机制,靶向该通路或联合免疫治疗有望改善患者预后。

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