唾液RNA图谱解析:乳腺癌非侵入性诊断与预后监测的新型生物标志物研究

【字体: 时间:2025年09月03日 来源:Molecular Oncology 4.5

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  这篇综述创新性地探索了唾液RNA作为乳腺癌(BC)诊断、分型和预后监测的非侵入性生物标志物。研究通过高通量RNA测序技术,鉴定了包括mRNA、lncRNA、miRNA和snRNA在内的多组学特征,揭示了唾液转录组与肿瘤分子亚型(如HR+/HER2-、TNBC)、组织学分型(IDC/ILC/DCIS)及淋巴结转移(LN+)的显著相关性。关键发现包括:1)建立10个稳定表达的唾液内参基因(如MYT1L、NOP56);2)发现58个BC特异性差异表达基因(如ASF1A、MIR197);3)鉴定出与 Lum-A/Lum-B亚型相关的GRIA2、CLDN9等标志物;4)首次报道淋巴结转移相关唾液特征基因(SEPTIN9、KIF21A)。研究为开发便捷、低成本的乳腺癌筛查策略提供了全新视角,尤其适用于资源有限地区的精准医疗实践。

  

唾液RNA景观特征解析:乳腺癌诊疗新维度的探索

研究设计与患者特征

研究团队通过前瞻性队列设计,收集40例乳腺癌患者和10例健康对照者的唾液样本,采用DNA Genotek专用管标准化采集流程。患者群体涵盖主要临床亚型:12例浸润性导管癌(IDC)、8例浸润性小叶癌(ILC)、6例混合型癌和8例导管原位癌(DCIS)。分子分型显示65%为激素受体阳性(HR+),包括15例Luminal A(Lum-A,Ki-67<15%)和11例Luminal B(Lum-B,Ki-67≥15%),另含3例HER2+和3例三阴性乳腺癌(TNBC)。年龄分布呈现典型乳腺癌发病曲线,确诊高峰位于50-70岁区间。

稳定表达基因的发现与验证

通过全转录组测序,研究者首次系统鉴定了3048个在唾液样本中稳定表达的基因。其中MYT1L、NOP56和MUC5AC在独立验证队列(n=32)中表现卓越,跨组变异系数(CV)<15%,可作为理想的内参基因。值得注意的是,MUC5AC作为黏膜防御蛋白,其稳定性提示唾液上皮屏障完整性可能影响RNA释放机制。

乳腺癌特异性唾液标志物

差异表达分析(FDR<0.05,log2FC>2)揭示58个显著上调的BC相关基因,包括:

  • 染色质调节因子ASF1A(在TCGA数据集中与不良预后相关)

  • 促癌miRNA MIR197(通过抑制TIMP3促进EMT)

  • 长链非编码RNA PELO-AS1(在卵巢癌中证实可激活Wnt通路)

共表达网络分析识别出四个功能模块:

  1. 1.

    miRNA模块(如MIR374A/MIR425)

  2. 2.

    snoRNA模块(SNORD95/SNORD121A)

  3. 3.

    基因调控模块(LINC02901/PSMC5)

  4. 4.

    lncRNA模块(DPP10-AS1/PDK1-AS1)

组织学分型标志物的突破

研究首次建立组织学特异性唾液标志物组合:

  • IDC特征基因:MUC16(CA125编码基因)在独立验证中表达量较对照高4.3倍(P=0.0097),与肿瘤组织数据高度一致

  • ILC特征基因:组蛋白去乙酰化酶HDAC3和紧密连接蛋白ZAN,在TCGA的ILC队列中特异性高表达

  • DCIS特征基因:基底膜成分LUM和粘附分子KIRREL2

分子分型与预后价值

在HR+亚型中,Lum-A特有的GRIA2(谷氨酸受体)和ROGDI(氧化应激响应因子)与良好预后相关,而Lum-B特征基因CLDN9(紧密连接蛋白)和FOXM1(细胞周期调控因子)在KM生存分析中高风险比达2.18(FDR<10%)。淋巴结转移(LN+)患者唾液中发现10基因特征信号,其中SEPTIN9(细胞骨架调节)和DTYMK(核苷酸代谢)在转移灶中表达较原发灶升高1.02倍(P=4.32e-96)。

治疗监测与前沿发现

15例患者的1年随访数据显示,化疗后唾液miRNA谱发生显著变化:

  • 促凋亡miR-34a表达下降72%

  • 血管生成抑制因子miR-15a降低58%

  • EMT相关基因CALD1下调3.1倍

研究还鉴定出89个新型Ensembl注释基因,其中16个特异性富集于ILC患者,为后续机制研究提供全新靶点。

这项研究构建了唾液RNA在乳腺癌诊疗中的多维应用框架,从早期筛查到疗效监测,展现出替代传统组织活检的潜力。特别在资源匮乏地区,基于唾液的"液体活检"可能成为改变诊疗范式的突破性技术。

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