牙髓炎中NET相关ceRNA网络的转录组学与功能探索：揭示新型分子机制与治疗靶点

研究人员针对牙髓炎缺乏特异性靶向治疗的问题，通过RNA测序和生物信息学分析构建了中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)相关的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络，鉴定出SIGLEC9/C3/H2AC14/H4C11等核心基因及LINC00466/hsa-miR-27a-3p等关键调控轴，实验证实NETs抑制剂可缓解炎症。该研究为牙髓炎分子机制提供了新见解，发表于《International Dental Journal》。

　　

牙髓炎是口腔常见疾病，主要由微生物感染引发，临床表现为剧烈疼痛和局部炎症反应。尽管现有治疗手段如根管治疗能缓解症状，但针对疾病核心机制的特异性药物仍属空白。近年来，非编码RNA(ncRNA)及其构成的竞争性内源RNA(ceRNA)网络被发现在炎症调控中发挥关键作用，这为揭示牙髓炎发病机制提供了新视角。然而，中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)在牙髓炎中的作用及其与ncRNA的调控关系尚未阐明。

为破解这一科学难题，南方医科大学口腔医学院的Xiaolan Guo、Buling Wu等团队在《International Dental Journal》发表重要研究。他们采用Illumina NovaSeq 6000平台对3例牙髓炎患者和3例健康者的牙髓组织进行全转录组测序，结合生物信息学分析筛选差异表达基因，通过随机森林和SVM-RFE算法鉴定核心靶点，并建立小鼠牙髓炎模型验证NETs抑制剂GSK484的治疗效果。关键技术包括：临床样本RNA测序、GO/KEGG通路富集分析、蛋白互作网络(PPI)构建、机器学习算法筛选hub基因、动物模型构建及免疫荧光染色等。

研究结果部分：

1. 1.

   差异表达基因鉴定：发现379个mRNA、204个lncRNA和250个circRNA在牙髓炎中异常表达，功能富集显示这些基因显著参与补体激活和NETs形成通路。

2. 2.

   核心基因筛选：通过PPI网络和机器学习确定SIGLEC9、C3、H2AC14和H4C11为关键基因，ROC曲线显示其诊断效能优异(AUC=1.0)。

3. 3.

   NETs功能验证：动物实验证实NETs抑制剂GSK484能减轻牙髓组织炎症浸润，降低MPO、citH3等NETs标志物表达。

4. 4.

   ceRNA网络构建：发现LINC00466/hsa-miR-27a-3p/SIGLEC9等4条调控轴，qPCR验证这些分子在炎症组织中表达变化。

5. 5.

   分子互作预测：揭示circRNA/lncRNA与miRNA的结合位点，如hsa_circSLC15A4_001通过hsa-miR-30d-3p调控H2AC14。

讨论与结论指出，该研究首次系统阐明NETs相关ceRNA网络在牙髓炎中的作用机制：

• •

  组蛋白H2AC14/H4C11和补体C3通过促进NETs释放加剧炎症

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  SIGLEC9作为中性粒细胞抑制受体可能负调控过度激活

• •

  鉴定出的ceRNA轴(如hsa_circGABBR2_009/hsa-miR-193b-3p/H4C11)为潜在治疗靶点

这项研究的创新性在于将NETs生物学与ceRNA理论相结合，不仅为理解牙髓炎发病机制提供了新框架，还为开发靶向NETs的精准治疗策略奠定基础。作者建议未来可探索NETs抑制剂与抗生素的联合疗法，并通过单细胞测序进一步解析牙髓微环境中细胞亚群的异质性调控网络。