2015年科罗拉多州奶牛源蓝舌病毒3型血清型全基因组测序及进化特征分析

来自美国的研究团队对蓝舌病毒(BTV)展开分子流行病学研究，通过全基因组测序技术解析了2015年科罗拉多州奶牛源BTV-3分离株的基因组特征。研究发现该毒株与美洲流行株高度同源，但与欧洲新型BTV-3存在显著差异，为理解BTV跨洲际传播和基因重配(Reassortment)提供了重要数据。

　　

蓝舌病毒(Bluetongue virus, BTV)作为环状病毒属(Orbivirus)的代表种，自1876年首次鉴定以来，已在全球反刍动物中引发多次疫情。最新研究揭示了2015年从科罗拉多州无症状奶牛分离的BTV-3血清型全基因组特征。通过Illumina NextSeq 500测序平台结合多重生物信息学分析，研究人员获得了包含VP1-VP7结构蛋白和NS1-NS3非结构蛋白的10个基因片段完整序列。

有趣的是，该BTV3/CO/2015毒株与美洲流行株显示出>97%的相似性，特别是与佛罗里达州白尾鹿分离株KY092160的VP2基因相似度高达99.3%。但与近期欧洲爆发的BTV-3/NET2023相比，除第7片段(92.6%)外，其余片段相似性均低于90%。这种显著的基因组差异提示不同地理株系可能存在独立进化路径。

研究采用创新的LiCl单链RNA沉淀法和ScriptSeq v2建库技术，平均测序深度达134-2476×。特别值得注意的是，VP7基因因其高GC含量(48.0%)和保守性，显示出最高的覆盖深度(2212×)。这些数据为理解BTV通过基因重配(Reassortment)产生新变异株的分子机制提供了重要线索。

该发现不仅完善了BTV基因数据库，更凸显了持续监测对预警新型毒株出现的重要性。特别是在当前欧洲新型BTV-3疫情背景下，这项研究为跨境动物疫病防控提供了宝贵的分子流行病学依据。