基于统计物理模型解析香兰素在三种哺乳动物嗅觉受体上的新型对接机制

【字体: 时间:2025年09月04日 来源:Scientific Reports 3.9

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  本研究针对嗅觉感知的分子机制难题,创新性地结合统计物理学与真实气体定律,构建了有限多层模型(L=1),首次定量揭示了香兰素(vanillin)在人类hOR8H1、黑猩猩cOR8H1和马hoOR8H1嗅觉受体上的非平行吸附特性。研究发现香兰素通过物理吸附(18.26-20.75 kJ/mol)以1-2个分子聚集形式结合受体,其能量谱带(12.43-25.30 kJ/mol)为嗅觉编码提供了新依据,为GPCRs嗅觉受体的跨物种研究建立了理论范式。

  

嗅觉感知的分子机制一直是生命科学领域的重大谜题。尽管已知400多种人类嗅觉受体(ORs)通过组合编码识别气味分子,但绝大多数受体的结构特征和激活机制仍不明确。香兰素作为食品关键气味分子(KFOs)的代表,虽已知能激活小鼠mOR-EG等受体,但其在人类hOR8H1及其跨物种同源受体(黑猩猩cOR8H1、马hoOR8H1)上的作用机制尚未阐明。由于这些受体缺乏晶体结构,传统实验手段难以揭示其分子层面的嗅觉编码规律。

为突破这一瓶颈,Ismahene Ben Khemis团队在《Scientific Reports》发表的研究中,开创性地将统计物理学理论与真实气体定律相结合。研究人员通过构建有限多层吸附模型,首次实现了对三种哺乳动物嗅觉系统阈值浓度(Cth)的定量分析,为嗅觉感知提供了全新的理论框架。

研究主要采用四种关键技术:1)基于HEK-293细胞的荧光素酶报告基因系统,定量检测hOR8H1/cOR8H1/hoOR8H1对香兰素的剂量响应曲线;2)从黑猩猩唾液和马唾液样本中克隆获得跨物种受体基因;3)建立耦合真实气体状态的统计物理模型(含7个物理化学参数);4)结合AlphaFold预测的受体结构进行分子对接验证。

模型构建与验证

通过比较10种层数模型(L=1-10)的拟合优度,最终确定L=1的单层模型最能解释实验数据(R2>0.997)。该模型突破传统Langmuir模型的局限,引入:

  • 立体参数n(每个结合位点吸附分子数)

  • 范德华参数a(内聚力)、b(共体积)

  • 能量参数XHS(半饱和浓度)

立体构象分析

关键发现显示香兰素以非平行方式吸附:

  • 人类hOR8H1:58%位点结合二聚体(n=1.58)

  • 黑猩猩cOR8H1:44%位点结合二聚体(n=1.44)

  • 马hoOR8H1:仅2%位点形成二聚体(n=1.02)

能量特征解析

吸附能计算揭示:

  1. 1.

    均为放热型物理吸附(ΔE=18.26-20.75 kJ/mol)

  2. 2.

    人类受体稳定性最高(a最小3.15×10-19 J·L/mol,b最大9.49×10-17 L/mol)

  3. 3.

    能量谱带具有物种特异性:

    • 人类:16.19-25.30 kJ/mol

    • 黑猩猩:15.14-24.50 kJ/mol

    • 马:12.43-24.00 kJ/mol

分子对接验证

与AlphaFold预测结构的对接显示:

  • 人类受体主要形成π-烷基/氢键(平均结合能21.57 kJ/mol)

  • 黑猩猩受体出现π-π堆积作用(20.86 kJ/mol)

  • 马受体存在独特的π-硫键(19.25 kJ/mol)

这项研究通过多学科交叉方法,首次建立了嗅觉受体激活的定量物理模型。其重要意义在于:

  1. 1.

    提出"嗅觉能量谱带"新概念,为 Turin振动理论提供实验依据

  2. 2.

    揭示香兰素在跨物种受体上的吸附差异,解释人类对香草气味的特殊敏感性

  3. 3.

    发展的L=1模型可推广至其他GPCRs研究,为缺乏晶体结构的膜受体研究提供新范式

  4. 4.

    证实统计物理方法在生物嗅觉研究中的独特价值,为人工嗅觉系统设计提供理论指导

研究也存在一定局限:未考虑pH/温度对吸附的影响,且假设受体构象刚性。未来可结合分子动力学模拟,进一步探索受体动态构象变化对嗅觉编码的影响。

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