中华绒螯蟹Wnt基因家族的全基因组鉴定及其在肢体再生中的表达调控机制

【字体: 时间:2025年09月04日 来源:Aquaculture and Fisheries CS7.5

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  本研究针对中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)中Wnt基因家族的系统研究空白,通过全基因组鉴定技术首次揭示该物种存在29个Wnt基因,发现Wnt7亚型特异性扩张现象,并证实Wnt5和Wnt11在肢体再生中的关键作用。研究为甲壳动物发育生物学和再生医学研究提供了重要分子靶点。

  

在生物医学领域,Wnt基因家族作为高度保守的分泌型糖蛋白编码基因,在胚胎发育、组织稳态和再生修复中扮演着核心角色。这类基因最初在小鼠乳腺肿瘤中被发现,因其与果蝇wingless基因的同源性而被命名为Wnt(Wingless-related integration site)。近年来,随着测序技术的突破性进展,科学家们逐渐揭开这个古老基因家族在各类生物中的神秘面纱。然而在甲壳动物特别是具有重要经济价值的中华绒螯蟹中,Wnt基因的系统研究仍是一片亟待开垦的处女地。这种被称为"大闸蟹"的物种不仅是中国淡水养殖的支柱产业,更因其惊人的肢体再生能力成为研究再生医学的理想模型。

正是基于这样的背景,由上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室Maolei Wei、Xinxin Chen等组成的研究团队在《Aquaculture and Fisheries》发表了开创性研究成果。研究团队整合生物信息学与分子生物学技术,首先从NCBI数据库获取49个物种的基因组数据,运用BLASTP进行同源基因检索;通过MAFFT和IQ-TREE构建系统发育树;利用Expasy分析蛋白理化性质;采用MEME和CDD数据库预测保守结构域;最后基于PRJNA733310和PRJNA1207707两个RNA-seq数据集解析表达模式。

研究结果部分呈现了系列重要发现:

"Wnts的鉴定"显示中华绒螯蟹拥有29个Wnt基因,数量远超其他节肢动物(如蜜蜂7个、赤拟谷盗9个),在十足目动物中呈现显著基因扩张现象。

"系统发育分析和染色体定位"将Wnt分为8个进化群,其中Wnt7亚型存在16个拷贝的物种特异性扩张。染色体定位揭示14个基因分布于染色体上,Wnt1/Wnt6/Wnt10形成保守基因簇。

"Wnts的保守结构"通过基序分析发现10个保守模体,所有成员均含典型Wnt结构域,证实该家族在进化中的高度保守性。

"不同组织的表达模式"显示Wnt4在眼柄高表达,Wnt16.1/Wnt16.2在鳃组织优势表达,提示这些基因可能参与感觉器官和呼吸系统的功能调控。

"肢体再生中的表达模式"最具突破性,发现Wnt5在截肢后30天、Wnt11在15天显著上调,暗示二者可能通过时序性调控参与再生过程的不同阶段。

在讨论环节,研究者将发现置于更广阔的进化生物学视角:Wnt7的扩张可能反映中华绒螯蟹对环境适应的特殊需求;Wnt5在刺胞动物和水螅再生中的保守功能被再次验证;而Wnt11与涡虫极性建立的关联暗示再生机制的跨物种保守性。这些发现不仅填补了甲壳动物Wnt基因研究的空白,更为解析节肢动物肢体再生的分子机制提供了关键线索。

该研究的创新价值体现在三方面:首次完成中华绒螯蟹Wnt家族全基因组图谱;发现十足目动物特异的Wnt7扩张现象;揭示Wnt5/Wnt11在甲壳动物再生中的新功能。这些成果为后续开展水产动物遗传育种、再生医学研究奠定了理论基础,也为探索Wnt信号通路在进化过程中的保守性与多样性提供了新模式生物。随着对Wnt基因调控网络认识的深入,未来或可通过基因编辑等技术手段,提升经济甲壳动物的再生能力和养殖效益。

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