综述:侵袭性B细胞淋巴瘤的计算模型

【字体: 时间:2025年09月04日 来源:Biochemical Society Transactions 4.3

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  这篇综述系统阐述了计算模型在解析弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)异质性中的突破性应用,涵盖数据驱动(LASSO/机器学习)和机制驱动(NF-κB/凋亡通路ODE模型)两大范式,强调通过数字孪生实现个体化治疗,为克服R/R-DLBCL(复发/难治性)提供新思路。

  

数据驱动与知识驱动的双轨策略

机器学习(ML)和最小绝对收缩选择算子(LASSO)等算法已成功从DLBCL的临床-基因组多组学数据中挖掘预后标志物。例如,LASSO筛选的基因表达特征可独立于国际预后指数(IPI)和细胞起源(COO)分层患者,其预测效能甚至超越随机森林算法。而LymphGen和DLBclass等分类工具通过贝叶斯模型或神经网络,将DLBCL细分为具有独特通路特征的分子亚型(如MCD亚型对BTK抑制剂敏感)。

NF-κB通路的建模突破

NF-κB信号网络在淋巴瘤中呈现亚基特异性调控:RelA驱动浆细胞分化,cRel促进增殖,RelB激活非经典通路。计算模型揭示,慢性NF-κB激活会重编程cRel响应模式,而微环境中的CD40L/BAFF信号通过IκBε等反馈调节器塑造肿瘤细胞耐药性。针对DNA损伤诱导的NF-κB活化,模型预测PARP抑制剂可增强放疗敏感性。

细胞命运的可预测性革命

多尺度模型整合BCL-2家族蛋白互作与细胞周期调控,证明MYChigh/BCL2high的"双打击"淋巴瘤存在协同致死效应。单细胞追踪实验证实,B细胞命运并非随机,而是由NF-κB/IRF4/Blimp1信号层级决定——这一发现为靶向药物组合设计奠定理论基础。

患者特异性模型的临床转化

逻辑模型将患者突变映射为网络节点状态(如CARD11突变设为持续激活),连续模型则量化突变对参数的影响(如BCL2拷贝数增加50%)。这些方法在虚拟临床试验中成功预测了依鲁替尼对MCD亚型的疗效差异。定量系统药理学模型还优化了CD20/CD3双抗的给药方案,降低细胞因子风暴风险。

挑战与未来方向

当前模型尚未完全解决克隆演化带来的时空异质性,且临床试验设计仍滞后于分子分型进展。突破需依赖三方面进化:①融合多组学数据的"白盒"模型开发;②药企合作推动个体化试验范式;③建立治疗抵抗机制的动态预测框架。最终目标是通过计算生物学实现"量体裁衣"式的淋巴瘤精准治疗。

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