武汉新种欧文氏菌（Erwinia wuhanensis sp. nov.）的发现：从人类血液分离的病原菌分类学与临床意义

本文报道了一株从中国武汉患者血液中分离的新型欧文氏菌（Erwinia wuhanensis sp. nov. BC051422T），通过多基因序列分析（16S rRNA、atpD、infB、rpoB、gyrB）、全基因组测序（ANI 68.8%-83.4%，isDDH 19.2%-35.5%）及生化特征（发酵蔗糖但不代谢甘露糖等），证实其为欧文氏菌属新种，对理解条件致病菌进化及医院感染防控具有重要价值。

　　

Introduction

一株具有临床意义的新型欧文氏菌BC051422^T从武汉某医院血液样本中分离。该患者为64岁女性，患慢性肾功能衰竭合并糖尿病，血液培养显示革兰阴性杆菌阳性。菌株经鉴定为兼性厌氧、具周生鞭毛的短杆菌，其16S rRNA基因与已知欧文氏菌相似度最高仅98.74%（E. tasmaniensis），暗示潜在新种可能。

Methods

研究采用多维度分类学技术：

1. 1.

   分子系统学：通过邻接法（NJ）、最大似然法（ML）构建16S rRNA系统树，并联合atpD、infB、rpoB、gyrB基因进行多基因位点序列分析（MLSA），显示菌株独立成簇。

2. 2.

   基因组学：Illumina测序组装获得4.6 Mb基因组（GC含量55.95 mol%），与近缘菌种的ANI和isDDH值均低于物种界定阈值（95%和70%）。

3. 3.

   表型特征：生化试验显示独特代谢模式——发酵蔗糖和阿拉伯糖，但不利用甘露糖、鼠李糖或山梨醇；主要脂肪酸为C_16:0（31.2%）和特征性环丙烷C_17:0 cyclo（11.4%）。

Results

1. 1.

   致病潜力：基因组注释预测121个毒力因子（VFDB），包括黏附、免疫调节相关蛋白，但侵袭性因子占比低，提示其为机会性病原体。抗生素耐药数据库（CARD）检出75个耐药相关基因，如RND家族外排泵基因rsmA。

2. 2.

   分类学结论：菌株与欧文氏菌属其他成员在基因型和表型上存在显著差异，最终命名为Erwinia wuhanensis sp. nov.，模式菌株保藏于GDMCC（1.4074^T）和JCM（36319^T）。

Discussion

该发现拓展了欧文氏菌的宿主范围（从传统植物病原到人类感染），其临床分离背景（合并多种基础疾病患者）为医院感染防控提供新警示。研究首次系统描绘了该菌的基因组特征与代谢网络，为后续致病机制研究奠定基础。

Description of E. wuhanensis sp. nov.

正式描述该新种为革兰阴性、氧化酶阴性、触酶阳性的短杆菌，最适生长温度30-35°C，pH 7.0。其基因组登录号JAUJUH010000000，16S rRNA序列号OQ938606，分类特征与临床数据共同构成物种定义的黄金标准。