铁死亡相关基因的多转录组学分析揭示CAFs外泌体COX4I2作为骨肉瘤治疗新靶点

【字体: 时间:2025年09月05日 来源:Frontiers in Cell and Developmental Biology 4.3

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  本研究通过多组学分析构建骨肉瘤铁死亡(ferroptosis)预后模型,结合机器学习筛选出基质细胞富集基因COX4I2。实验证实癌症相关成纤维细胞(CAFs)通过外泌体传递COX4I2蛋白至骨肉瘤细胞,抑制铁死亡关键指标(Fe2+/ROS/MDA),促进肿瘤增殖。该研究为靶向肿瘤微环境(TME)的骨肉瘤治疗提供新策略。

  

背景

骨肉瘤作为儿童青少年高发的原发性恶性骨肿瘤,其高复发率与治疗困境凸显探索新治疗靶点的紧迫性。铁死亡作为一种铁依赖性程序性细胞死亡形式,近年被证实与肿瘤恶性进展密切相关,但其在骨肉瘤中的调控机制尚不明确。

材料与方法

研究团队整合TARGET和GEO数据库(GSE21257/GSE39055),通过LASSO回归构建包含12个铁死亡驱动基因(ALOX15B、COX4I2等)的预后模型。采用支持向量机(SVM)、随机森林(RF)等机器学习算法筛选核心基因,结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)定位COX4I2的细胞来源。通过透射电镜(TEM)、Western blot验证CAFs外泌体对COX4I2的递送作用,并检测铁死亡标志物(Fe2+/ACSL4/ROS)。动物实验采用裸鼠移植瘤模型评估肿瘤生长。

结果

  1. 1.

    预后模型构建:风险评分可显著区分患者生存期(HR=6.5, p<0.001),3年/5年AUC达0.857/0.901。免疫浸润分析显示高风险组与B细胞、CD4+ T细胞等显著相关。

  2. 2.

    关键基因发现:机器学习联合scRNA-seq锁定COX4I2为CAFs特异性高表达基因,其过表达患者生存期缩短(p<0.05)。

  3. 3.

    机制解析:CAFs通过外泌体将COX4I2转移至143B骨肉瘤细胞,导致:

    • 铁代谢紊乱:细胞内Fe2+水平下降40%(p<0.001)

    • 线粒体保护:膜密度降低、嵴结构完整(电镜证实)

    • 增殖增强:Edu阳性率提升2.1倍(p<0.001)

  4. 4.

    体内验证:过表达COX4I2使移植瘤体积增加58%(p=0.0014),GPX4表达上调提示铁死亡抑制。

讨论

研究首次揭示CAFs通过外泌体COX4I2-铁死亡轴促进骨肉瘤进展的机制:

  • 临床价值:COX4I2可作为预后生物标志物,其外泌体递送路径(如GW4869靶向干预)具治疗潜力。

  • 理论创新:突破传统"肿瘤细胞自主性铁死亡调控"认知,阐明基质细胞非细胞自主调控模式。

  • 局限性:需进一步验证患者组织中外泌体COX4I2的临床相关性。

结论

该研究为骨肉瘤提供了新型铁死亡相关预后工具,并揭示CAFs外泌体COX4I2作为联合治疗靶点,为逆转肿瘤微环境介导的治疗抵抗提供新思路。

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