综述：利用50年蜱种群遗传学研究：为当代研究选择合适的分子工具

这篇综述系统梳理了蜱类种群遗传学50年来的技术演进，从早期的同工酶电泳到现代全基因组测序（WGS），重点对比了RAPD、微卫星（STRs）、AFLP、序列分型、RADseq等方法在成本、通量和分辨率上的优劣，为研究蜱媒病原体传播机制和种群适应策略提供方法论指导。

　　

1 种群遗传学的价值

种群遗传学通过解析基因流动和亲缘关系，成为研究蜱媒疾病传播的关键工具。随着气候变化和牲畜贸易加剧蜱类扩散，该技术能揭示种群适应新生态位的潜力，例如亚洲长角蜱（Haemaphysalis longicornis）通过牲畜运输实现全球入侵。图1显示1970-2024年种群遗传工具使用趋势，RADseq和WGS正逐步取代传统方法。

2 蜱类及其影响

作为专性吸血寄生虫，硬蜱（Ixodidae）和软蜱（Argasidae）通过复杂生命周期传播莱姆病（Borrelia burgdorferi s.l.）和牛贫血症（Theileria orientalis）等病原体。图2展示蜱类与宿主、气候、土地利用的生态网络，其中野生动物作为宿主-病原体枢纽的作用尤为突出。

3 环境变迁下的种群结构

气候变暖延长蜱类活跃期，如蓖子硬蜱（Ixodes ricinus）向北欧扩张。牲畜贸易则促进长角蜱跨洲传播，美国2017年入侵事件显示其能寄生白尾鹿（Odocoileus virginianus）等7种宿主。森林砍伐等人为干扰通过改变宿主密度影响蜱群动态，野火可使蜱密度降低长达2年。

4 分子工具发展历程

同工酶电泳（1970s）首现于澳大利亚巨蜥蜱（Bothriocroton hydrosauri）研究，但蛋白表达易受选择压力干扰。

RAPD（1990s）通过随机引物扩增创建"指纹"，但重复性差，如微小扇头蜱（Rhipicephalus microplus）抗药性研究中假阳性率高。

微卫星（2000s）利用非编码区STR高突变率，在美洲花蜱（Dermacentor variabilis）宿主分化研究中展现精细分辨率，但跨物种适用性低。

AFLP仅1项研究用于变异革蜱（D. variabilis）杂交鉴定，因无法检测杂合度被淘汰。

序列分型采用线粒体COI/16S和核ITS2标记，证实北美肩突蜱（Ixodes scapularis）与达明蜱（I. dammini）实为同种，适合大尺度进化研究。

RADseq通过酶切建库检测SNP，在变异革蜱东西部亚群鉴定中比线粒体标记敏感10倍。

WGS虽成本高，但低覆盖度测序已用于肩突蜱局部适应研究，长读长技术（ONT/PacBio）更适用于富含重复序列的蜱基因组。

5 多维度数据整合

DNA样本可同步解析微生物组（如犬埃立克体Ehrlichia canis）和宿主来源。环境参数如南方涛动指数（SOI）能预测澳洲硬蜱（Ixodes holocyclus）麻痹症爆发风险，结合种群遗传数据可构建传播预警模型。

6 应用建议与展望

当前序列分型和RADseq在成本（50-99澳元/样本）与数据量间达成最佳平衡。WGS虽能实现宏基因组分析，但100-500澳元/样本的价格限制其应用。未来计算生物学发展将提升海量SNP数据处理能力，为蜱媒疾病防控提供进化生态学依据。