综述：利用循环游离DNA中的病毒足迹进行早期癌症检测：聚焦液体活检筛查

这篇综述系统阐述了循环游离DNA(cfDNA)在病毒相关癌症早期检测中的突破性应用，重点分析了EBV、HPV等致癌病毒通过整合宿主基因组、激活癌基因等机制释放的病毒DNA片段。作者详细探讨了cfDNA的生物发生机制、病毒特异性标记物检测技术(ddPCR/NGS)及临床转化价值，为开发非侵入性诊断工具提供了重要理论依据。

　　

病毒与癌症的致命关联

约15.4%的人类癌症与感染相关，其中9.9%由EBV、HPV、HBV等7种致癌病毒直接引发。这些病毒通过基因组整合（如HPV16整合至宿主DNA）、表观遗传调控等机制，劫持细胞周期检查点蛋白p53/pRB，驱动肿瘤发生。值得注意的是，病毒可长期潜伏，利用宿主细胞分裂机制逃避免疫监视。

cfDNA：肿瘤的液态指纹

循环游离DNA(cfDNA)是血液中游离的DNA片段，包含来自凋亡/坏死细胞的核DNA和线粒体DNA。在癌症患者中，肿瘤细胞释放的ctDNA占比可达总cfDNA的0.1%-1%，其半衰期仅16分钟至2.5小时。通过分析170bp的核小体保护片段或5kb的长片段，可追溯肿瘤特异性突变。

病毒cfDNA的检测革命

数字PCR(ddPCR)和下一代测序(NGS)技术将病毒cfDNA检测灵敏度提升至0.004%：

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  EBV cfDNA筛查鼻咽癌灵敏度达97.1%

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  HPV E7 cfDNA诊断宫颈癌特异性达97.8%

  新兴的CRISPR-Cas13系统通过crRNA识别病毒RNA，为居家检测带来可能。

临床转化里程碑

表1汇总的关键研究显示：

• 血浆EBV DNA水平可预测鼻咽癌复发风险

• HPV ctDNA动态监测指导宫颈癌精准治疗

• HBV-人类嵌合DNA作为肝癌特异性标志物

VirCAPP-Seq技术还能解析病毒整合位点，如发现HBV偏好整合至TERT启动子区。

挑战与未来

当前面临cfDNA碎片化、检测成本高等瓶颈。多组学整合是突破方向：

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  甲基化特征区分病毒整合位点

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  片段组学分析核小体占位模式

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  纳米孔测序实现单分子长读长检测

  随着cfSort等深度学习模型的应用，液体活检有望成为癌症早筛的"黄金标准"。