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L110M突变对ATTR(105–115)肽组装结构与稳定性的影响:分子动力学模拟揭示淀粉样纤维化新机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月05日 来源:Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 2.8
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来自国际团队的研究人员通过18 μs全原子分子动力学(MD)模拟,首次揭示了L110M突变对转甲状腺素蛋白(ATTR)淀粉样聚集的调控机制。研究发现该突变使2/4/8肽体系的β-折叠含量提升1%~5%,MM-PBSA计算证实M110残基显著增强结合自由能,为TTR相关淀粉样变性的靶向治疗提供了分子层面新见解。
淀粉样蛋白组装机制一直是结构生物学家的研究热点,这项研究首次通过计算手段揭示了L110M突变如何影响转甲状腺素蛋白(TTR)的聚集行为。采用三重重复的1 μs全原子分子动力学(MD)模拟(总时长18 μs),科研人员对比分析了野生型和L110M突变型ATTR(105–115)片段中交叉β淀粉样纤维的构象动力学。
有趣的是,L110M突变在所有寡聚体中均表现出β-折叠含量的提升:二聚体、四聚体和八聚体分别比野生型提高了约1%、5%和4%。分子力学泊松-玻尔兹曼表面积(MM-PBSA)计算显示,突变体的有效结合自由能更高,其中M110残基对体系稳定性的贡献尤为突出。这些发现表明,L110M在不引起重大结构破坏的前提下,能适度增强TTR肽组装的构象有序性和稳定性,为理解TTR相关疾病中的淀粉样蛋白形成机制提供了新的分子视角。
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