综述：肠道病毒轴：揭示病毒对肠道菌群失调的贡献及炎症性肠病转化医学研究

这篇综述系统阐述了肠道病毒轴（Gut-virus axis）在炎症性肠病（IBD）中的关键作用，聚焦噬菌体（Caudovirales）和真核病毒通过调节菌群平衡、免疫信号（如IL-23/Th17通路）和肠屏障完整性影响IBD发病的机制，并探讨了病毒组学（Virome）技术、噬菌体疗法（Phage therapy）和粪菌移植（FMT）等转化医学应用前景。

　　

1. 引言

炎症性肠病（IBD）包括克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC），其发病与肠道菌群（Gut microbiota, GM）紊乱密切相关。近年研究发现，肠道病毒轴——主要由噬菌体和真核病毒组成——通过调控细菌种群和宿主免疫，成为IBD的新型调控枢纽。健康人群中，病毒组维持稳定状态，而IBD患者则表现出噬菌体（如Caudovirales）丰度升高、病毒多样性降低等特征，这些变化可能通过溶解有益菌（如Faecalibacterium prausnitzii）或激活促炎因子（如TNF-α）加剧疾病。

2. 肠道病毒轴在IBD发病中的作用

2.1 噬菌体的菌群调控功能

噬菌体通过裂解特定细菌（如致病性Escherichia coli）或水平基因转移（HGT）影响菌群平衡。例如，IBD患者中增多的Caudovirales噬菌体可靶向降解产短链脂肪酸（SCFA）的共生菌，导致抗炎物质（如丁酸盐）减少和肠屏障损伤。

2.2 病毒诱导的免疫失调

真核病毒（如巨细胞病毒CMV）通过Toll样受体（TLR）和MDA5通路激活免疫反应，破坏上皮完整性。临床数据显示，抗病毒药物（如更昔洛韦）可改善CMV阳性IBD患者的症状，印证病毒直接参与炎症进程。

3. 临床证据与治疗探索

3.1 病毒组特征

IBD患者的黏膜样本中，噬菌体与细菌比例显著改变，且病毒多样性降低与疾病活动度正相关。例如，克罗恩病患者肠道内Crassvirales噬菌体的减少可能削弱其对致病菌的抑制能力。

3.2 病毒靶向治疗

噬菌体疗法在动物模型中已成功靶向清除黏附侵袭性大肠杆菌（AIEC），而粪病毒移植（FVT）则通过重建健康病毒组缓解结肠炎。此外，益生菌（如Lactobacillus）和益生元（如果寡糖）可通过调节病毒-细菌互作改善微环境。

4. 挑战与未来方向

当前研究面临病毒"暗物质"（未注释序列）解析困难、标准化流程缺失等瓶颈。未来需结合多组学（如代谢组学）和人工智能，开发基于病毒组特征的IBD分型诊断工具，并推动个体化噬菌体鸡尾酒疗法的临床转化。

（注：全文严格依据原文内容缩编，未添加非文献支持结论）