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Pick病顶叶皮层MAPT转录本多样性解析:长读长RNA测序揭示3R tau蛋白病的剪接调控新机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月05日 来源:npj Dementia
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本研究利用长读长RNA测序技术(LR RNA-Seq)首次系统解析了Pick病(PiD)患者顶叶皮层中微管相关蛋白tau基因(MAPT)的转录本多样性。通过比较3R tau蛋白病与对照样本,发现2N3R/2N4R转录本比例显著升高,并鉴定出包含外显子6的新型剪接变体。该研究为理解tau蛋白病(tauopathies)的分子机制提供了新视角,对开发RNA靶向治疗策略具有重要意义。
在神经退行性疾病研究领域,tau蛋白异常聚集形成的tau蛋白病(tauopathies)一直是科学家们关注的焦点。这类疾病包括阿尔茨海默病(AD)、Pick病(PiD)和进行性核上性麻痹(PSP)等,其共同特征是tau蛋白在神经元内形成病理性包涵体。有趣的是,不同tau蛋白病表现出截然不同的tau亚型偏好:PiD以3重复tau(3R)为主,PSP则以4重复tau(4R)为主,而AD则呈现3R+4R混合病理。这种选择性背后隐藏着什么分子秘密?传统观点认为,MAPT基因外显子10的选择性剪接决定3R/4R比例,但越来越多的证据表明,tau蛋白的转录调控远比想象中复杂。
正是基于这些未解之谜,Nicole Tamvaka和Owen A. Ross团队在《npj Dementia》发表了开创性研究。他们采用太平洋生物科学公司(PacBio)的Iso-Seq长读长RNA测序技术,对8例PiD患者和4例对照的顶叶皮层样本进行全转录组分析。研究团队开发了多步骤分析流程,结合Flair和SQANTI3软件,通过匹配短读长(SR)RNA测序数据进行验证,最终鉴定出50种MAPT转录本。为验证发现,他们还使用RT-PCR在独立队列(20例PiD、10例对照和20例PSP)中检测了外显子6的表达水平。
MAPT转录本鉴定与分类
通过严格的过滤标准,研究最终锁定19个高频表达的MAPT转录本。其中7个为已知转录本(包括5种经典亚型:0N3R、1N3R、0N4R、1N4R和2N4R),以及一个含123bp新型外显子的0N4R变体(ENST00000680674.1)。值得注意的是,研究者首次在顶叶皮层发现包含外显子6的完整转录本(MAPT_tx_a和MAPT_tx_l),这些转录本在PiD患者中表达显著升高。
MAPT 3R/4R转录本比例
分析显示,PiD与对照组的总体3R/4R比例无显著差异(PiD中位数0.99 vs 对照1.16)。但当聚焦N端变异时,PiD患者的2N3R/2N4R比例显著高于0N3R/0N4R(P=0.0468),这种差异在携带H2单倍型的样本中尤为明显。研究者推测,MAPT H2单倍型可能通过促进外显子3的保留,特异性增加2N3R转录本的表达。
转录本丰度特征
外显子6包含型转录本在PiD中表达量是对照组的2.3倍(P=0.0414),RT-PCR验证显示这种差异在独立队列中依然显著(P=0.0283)。此外,研究者还发现一个含41个氨基酸插入的tau变体(ENST00000680674.1)在PiD中高表达,这种插入位于微管结合域,可能影响tau蛋白功能。
讨论与展望
这项研究突破了传统tau研究的局限,首次系统描绘了3R tau蛋白病的转录组全景。发现外显子6在PiD中的特异性上调尤为关键,因为该外显子通常被认为主要在周围神经系统表达。研究者提出假说:外显子6可能通过改变tau蛋白构象,促进3R tau的病理聚集。此外,2N3R转录本在H2单倍型个体中的优势表达,为解释MAPT H2与PiD的遗传关联提供了新机制。
这些发现对tau蛋白病的精准治疗具有双重意义:一方面,外显子6可能成为PiD的特异性治疗靶点;另一方面,不同N端亚型的比例变化提示我们需要重新评估现有tau靶向药物的作用机制。研究者建议未来应开展单细胞长读长测序,以明确这些剪接变体的细胞特异性表达模式。正如通讯作者Owen A. Ross强调的:"理解tau剪接的复杂性,是开发下一代RNA疗法的关键一步。"这项研究不仅填补了3R tau蛋白病分子机制的空白,更为神经退行性疾病的转录组学研究树立了新标杆。
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