母体HIV感染状态对新生儿早期微生物组的影响：来自博茨瓦纳NICU的队列研究

本研究针对HIV暴露未感染(HEU)婴儿健康差异的潜在机制，通过16S rRNA测序分析了博茨瓦纳57名住院新生儿（33%为HEU）出生72小时内的鼻、皮肤和直肠微生物组。研究发现微生物组差异主要存在于母亲孕期新确诊HIV的亚组中，提示HIV相关微生物组变异可能随婴儿成长逐渐显现。该研究为理解HEU婴儿健康风险提供了早期微生物组证据，对优化HIV暴露婴儿的临床管理具有重要价值。

　　

在撒哈拉以南非洲地区，尽管母婴传播HIV的防控取得显著进展，HIV暴露未感染(HEU)婴儿仍面临两倍于未暴露(HU)婴儿的死亡风险。这种"HEU悖论"的机制尚未明确，而微生物组作为免疫调节的关键因素，可能在其中扮演重要角色。既往研究多聚焦于婴儿后期肠道菌群，而对生命最初72小时——这个微生物组定植关键窗口期的研究仍属空白。

来自宾夕法尼亚大学等机构的跨国团队在《Journal of the Pediatric Infectious Diseases Society》发表研究，首次系统评估了母体HIV状态对新生儿早期多部位微生物组的影响。研究采用前瞻性队列设计，在博茨瓦纳转诊医院NICU收集57名新生儿（19例HEU）的鼻、皮肤和直肠样本，通过16S rRNA V1-V2区测序和生物信息学分析（QIIME2流程，DADA2算法），结合临床数据解析微生物组特征。

微生物组样本的个体差异大于解剖部位差异

分析显示：皮肤样本物种数最多但鼻样本香农指数最高；加权UniFrac距离揭示个体差异(R²=0.53)显著大于部位差异(R²=0.10)；皮肤-直肠样本差异随日龄增大，提示微生物组快速演化。

HIV暴露整体无显著差异，但亚组分析现端倪

虽然HEU与HU婴儿的α多样性无差异，但母亲孕期新确诊HIV(HEU-new)的婴儿鼻/皮肤微生物组β多样性显著不同于HIV孕前确诊(HEU-pre)和HU婴儿(p<0.05)。鼻样本中HEU-new组梭杆菌属(Fusobacterium)丰度显著降低。

病原体分布打破常规解剖定位

耐人寻味的是：肺炎克雷伯菌(K. pneumoniae)在直肠样本占比最高，而鲍曼不动杆菌(A. baumannii)在鼻样本占优；1例鲍曼不动杆菌败血症婴儿的感染部位与微生物组检测高度吻合，证实了方法敏感性。

这项研究揭示了三个重要发现：首先，新生儿早期微生物组呈现"个体特征强于部位特征"的独特模式；其次，仅母亲孕期新发HIV感染会显著改变新生儿微生物组，这可能与病毒载量或ART时机有关；最后，病原体在NICU环境中的非典型分布提示医院暴露可能覆盖生理性定植规律。研究为HEU婴儿健康风险的微生物组机制提供了新视角，强调需要关注母亲HIV诊断时机对婴儿微生态的影响。未来研究应扩大样本量，结合病毒载量和ART方案数据，并追踪微生物组演化与临床结局的关联。