综述:通过基因组学和转录组学整合改进胰腺囊肿的诊断

【字体: 时间:2025年09月05日 来源:Diagnostic Histopathology CS1.3

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  这篇综述系统阐述了分子诊断技术(如NGS)在胰腺囊肿风险分层中的革新作用,重点分析了IPMN和MCN的突变特征,并对比了传统方法(如CEA检测、细胞学)与多组学平台(如PancreaSeq GC)的效能差异,为精准诊疗提供了基因组学(KRAS/GNAS突变)、表观遗传学(甲基化标志物)及microRNA等多维解决方案。

  

胰腺囊肿的诊断困境与分子曙光

胰腺囊肿因其生物学谱系广泛且手术风险高,长期以来面临诊断挑战。传统依赖影像学、CEA水平和细胞学的方法敏感性不足,而分子诊断技术的出现彻底改变了这一局面。

常见驱动突变

IPMN和MCN中KRAS突变(如G12D/V/R)占比高达89%,GNAS突变则对IPMN更具特异性。值得注意的是,这些突变与异型增生程度无明确关联,提示需要更全面的分子标记。

分子分析方法论

内镜超声引导下细针穿刺(EUS-FNA)获取的囊液是主要检测材料。现代流程将囊液分为三部分:细胞学涂片、CEA/淀粉酶检测上清液,以及用于DNA提取的残留固定标本。酒精固定标本的DNA提取率可达90%,为后续分析奠定基础。

历史性突破

2005年首次证实囊液含诊断价值DNA后,研究重点从KRAS突变检测扩展到包括LOH分析。早期数据显示高突变等位基因频率(尤其抑癌基因位点)与恶性程度相关。

PancreaSeq技术演进

初代22基因Panel在97例标本中验证后,扩展至74基因的PancreaSeq GC整合了基因融合检测、CEACAM5/CHGA RNA定量PCR,显著提升对高级别瘤变的识别能力(AUC 0.93 vs 传统方法0.72)。

microRNA标志物

Hanno团队开发的9-miRNA模型区分需手术与可保守治疗的囊肿时,展现出100%特异性。MD安德森研究则发现miR-215-5p等标志物可预测IPMN恶性转化。

表观遗传学进展

TBX15/BMP3甲基化标志物组合检测高级别瘤变的性能(敏感度90%,特异度92%)显著优于KRAS或CEA单独检测。

未来方向

尽管多组学方法已大幅提升诊断精度,但样本异质性和克隆进化仍是挑战。持续优化检测灵敏度、探索液体活检应用,将是下一阶段研究重点。

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