低温辅助纳米孔技术直接鉴定O-糖肽及其在癌症诊断中的应用

【字体: 时间:2025年09月05日 来源:Research 10.7

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  为解决O-糖肽因糖链复杂性和异质性导致的检测难题,研究人员开发了一种低温纳米孔技术,可同时区分4种截短O-糖肽变体(Tn/STn/TF/STF),准确率达92.9%。该技术无需标记即可实现直接鉴定和相对定量,为癌症早期诊断提供了新工具。

  

糖基化修饰是蛋白质翻译后修饰中最复杂的类型之一,尤其在癌症中,异常的O-糖基化模式(如MUC1蛋白的截短糖链)已成为重要生物标志物。然而,传统检测方法如质谱(LC-MS/MS)和免疫分析面临糖链电离效率不均、抗体交叉反应等技术瓶颈,且无法实现多组分同步精准检测。纳米孔技术虽具备单分子检测潜力,但糖肽的庞大空间位阻和相似电流信号使其区分困难。

针对这一挑战,研究团队创新性地提出低温(10°C)和低pH(3.0)协同调控策略,通过改造K238G Aerolysin(AeL)纳米孔,增强糖肽捕获能力并延长相互作用时间。实验表明,低温条件使糖肽在纳米孔内的停留时间延长1.5-1.8倍,电流阻塞信号分离度显著提升。研究选取MUC1重复串联区(VNTR)的四种截短O-糖肽变体——Tn(GalNAcα-)、STn(Neu5Acα2-6GalNAcα-)、TF(Galβ1-3GalNAcα)和STF(Neu5Acα2-3Galβ1-3GalNAcα-)作为模型,在+160 mV电压下实现92.9%的机器学习分类准确率(AUC=0.995)。

关键技术包括:1)K238G AeL纳米孔构建与表征;2)低温(10°C)及酸性(pH 3)条件下单通道电流记录;3)基于阻塞电流(I/I0)、持续时间、标准差和偏度的四维特征提取;4)多层感知机(MLP)模型训练与验证。

研究结果显示:

  1. 1.

    单O-糖肽检测条件优化:酸性环境使K238G AeL孔道内正电荷残基(R282/R220/K242)暴露,增强电渗流(EOF)。与野生型(WT)肽相比,Tn肽的纳米孔相互作用焓变更高(47.74 vs 25.89 kJ/mol),熵变更低(-20.3 vs -95.2 J/mol·K),说明GalNAc修饰增强结合稳定性。

  2. 2.

    多组分区分能力:STn与STF因唾液酸羧基与孔道精氨酸相互作用呈现双峰分布,通过聚类分析分离后,五类肽变体(含WT)的I/I0值差异显著(WT:0.45, Tn:0.36, TF:0.33, STn:0.18, STF:0.10)。

  3. 3.

    实际样本验证:在含0.2%细胞裂解液或1%牛血清白蛋白(BSA)的复杂基质中,模型仍能准确识别糖肽组分,如STn在混合样本中的回收率达93.3%-99.4%。

结论指出,该技术突破了传统方法对糖肽检测的通量和灵敏度限制,未来结合纳米孔阵列芯片可推动糖基化标志物的高通量筛查。研究局限性在于实际样本中糖肽浓度(纳摩尔级)需抗体预富集,且更长糖链需酶解后分段检测。论文发表于《Research》,为癌症糖组学分析提供了革命性工具。

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