石油降解菌Pseudomonas aeruginosa DG-1基因组草图解析：从重度石油污染土壤中发掘的生物修复潜力

为解决石油污染治理难题，来自中国的研究团队对石油降解菌Pseudomonas aeruginosa DG-1进行全基因组测序。该菌株分离自大港油田（117°43′34″ E, 38°77′34″ N），基因组6.73 Mb（GC 66.07%），携带alkM、pcaG等石油降解基因及rhl群体感应系统，为微生物修复技术提供重要分子机制。

　　

在石油污染治理领域，一株名为Pseudomonas aeruginosa DG-1的超级降解菌从中国大港油田的重度污染土壤（坐标117°43′34″ E, 38°77′34″ N）中脱颖而出。研究人员通过梯度驯化法，让这株革兰氏阴性菌在含5%原油的培养基中练就"吃油"绝技——其标志性的黄色半透明菌落还会分泌绿色水溶性色素。

借助PacBio Sequel IIe和NovaSeq X Plus双平台测序，科学家们破解了这株细菌的6,734,315 bp环形基因组密码（GC含量66.07%）。精密的生物信息学分析揭示：6,213个编码基因中暗藏玄机——既有直接分解原油的"武器库"（如alkM、pcaG基因），又有制造生物表面活性剂的"秘密配方"（rhl基因簇），还有细菌间通讯的"分子对讲机"（lasR-lasI和rhlR-rhlI群体感应系统）。

这项研究不仅展示了微生物基因组学的强大解析能力（使用Unicycler组装、PGAP注释），更揭示了环境微生物在应对碳氢化合物污染时的精妙适应策略。菌株DG-1的基因组蓝图，为开发新一代生物修复技术提供了分子路线图。