广岛传统腌菜乳酸菌基因组测序揭示益生菌资源与发酵机制

来自日本的研究团队对广岛传统腌菜（Hiroshimana old pickle）调味液中的乳酸菌进行基因组测序，成功分离鉴定出Lactiplantibacillus plantarum等5株乳酸菌，揭示了其潜在益生功能及代谢特性，为开发功能性发酵食品和环保饲料（eco-feed）提供重要菌种资源。

　　

广岛特产腌菜（Hiroshimana old pickle）的调味液中暗藏玄机！科学家们通过MRS培养基分离出五株乳酸菌家族成员，包括植物乳杆菌（Lactiplantibacillus plantarum）、戊糖片球菌（Pediococcus ethanolidurans）等。这些菌株在pH4的严苛环境下仍能存活，其基因组测序数据揭示：最大基因组达3.41Mbp（SHA2株），GC含量35.3%-44.2%，携带7个rRNA基因和55-66个tRNA基因。

研究团队采用DNBSEQ T7平台进行150×150双端测序，经MEGAHIT组装后获得N50达91.7kbp的高质量草图基因组。特别有趣的是，这些菌株曾与产多不饱和脂肪酸（PUFAs）的裂殖壶菌（Aurantiochytrium sp.）共处一室，暗示它们可能成为环保饲料（eco-feed）的"黄金搭档"。系统发育树显示SHB14株与戊糖片球菌亲缘关系最近（100%匹配），而SHB9株作为食品伴生乳杆菌（Companilactobacillus alimentarius）拥有独特的35.3%低GC含量。

这些基因组数据（登录号BAAHNJ000000000等）就像打开传统发酵食品奥秘的钥匙，不仅藏着风味形成的密码，更蕴含改善牲畜肠道健康的益生潜力。BUSCO评估高达97.5%的完整度，确保这些遗传蓝图足够可靠，为未来开发功能性饲料和发酵食品奠定基础。