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帕金森病血液DNA损伤特征谱揭示疾病进展新机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月06日 来源:Nature Aging 19.4
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本研究针对帕金森病(PD)异质性高、缺乏有效进展预测标志物的临床难题,通过分析帕金森病进展标志物倡议(PPMI)队列484例患者血液转录组数据,首次发现DNA修复通路下调与长转录本表达偏倚构成的DNA损伤特征谱,该特征在3年随访中仅见于运动症状快速进展患者,并在独立队列和尸检脑组织(TH+神经元γH2AX焦点增加)验证。研究发表于《Nature Aging》,为PD亚型分型和精准诊疗提供新靶点。
背景与挑战
帕金森病作为第二大神经退行性疾病,90%病例为散发性(iPD),其临床异质性严重阻碍治疗开发。尽管已知衰老是主要风险因素,但年龄相关DNA损伤如何参与PD发病仍不清楚。现有研究存在三大瓶颈:外周标志物缺乏预测性、DNA修复缺陷证据矛盾、遗传亚型(如LRRK2与GBA突变)机制差异不明。
技术方法
研究团队利用PPMI队列纵向血液转录组数据(基线484例PD/187对照,36个月随访268例PD/157对照),采用Salmon量化工具和DESeq2差异表达分析,结合基因集富集分析(GSEA)和基因长度偏倚分析(ALBATRO)检测DNA损伤特征。通过免疫荧光在独立PD队列外周血单核细胞(PBMC)和伦敦皇后广场脑库提供的尸检黑质组织(9例PD/7对照)中验证γH2AX焦点。
关键发现
DNA修复通路时空动态
基线检测显示iPD和LRRK2 G2019S携带者DNA修复通路(如HALLMARK_DNA_REPAIR)显著下调,而GBA突变患者未见此现象。36个月随访发现快速进展组(ΔUPDRS III>0)基线时即存在修复通路抑制,而缓慢进展组(ΔUPDRS≤1)仅在随访期出现DNA损伤积累特征。

长基因转录抑制标志
ALBATRO分析揭示iPD患者在36个月时出现长基因(中位数40,692bp)显著下调(P=0.0011),而前驱期患者该特征更早出现(P=0)。染色体脆弱位点(CFS)基因分析进一步验证该现象(z检验P<0.0001)。

跨组织验证
FUMA分析显示血液差异表达基因(DEG)与黑质功能基因高度重叠(如SNCA)。尸检证实PD患者黑质致密部TH+神经元γH2AX焦点数增加1.5倍(P<0.0001),且>5焦点神经元比例近乎翻倍(P<0.0007)。

临床转化价值
该研究首次建立PD外周血DNA损伤特征谱与疾病进展的预测关联,其价值体现在三方面:
提出DNA修复能力缺陷是PD异质性的分子基础,LRRK2与GBA亚型存在机制分歧
血液转录组特征可提前36个月预测运动症状恶化风险
为开发PD液态活检(如γH2AX检测联合ALBATRO)提供新思路
研究局限性在于血液细胞组成变化可能影响信号解读,未来需结合单细胞测序验证。这项由Daisy Sproviero、César Payán-Gómez等完成的工作,为理解PD衰老相关机制开辟了新视角,其发现的分子特征有望成为临床试验分层的新标准。
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