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综述:基于荧光RNA适体的生物传感器在细胞成分多样化照明中的应用:从标准化到创新
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月06日 来源:TrAC Trends in Analytical Chemistry 11.8
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这篇综述系统阐述了基于荧光RNA适体(FRAP)的生物传感器技术进展,聚焦其通过RNA可编程性实现小分子、蛋白质和RNA的动态可视化监测,总结了传感器构建方法(如SELEX筛选、核酶诱导切割)、性能优化策略(如人工凝聚体增强稳定性)及在活细胞成像中的应用(如代谢物追踪、RNA定位),为解码复杂细胞响应提供创新工具。
随着绿色荧光蛋白(GFP)在活体成像中的局限性逐渐显现,基于荧光RNA适体(FRAP)的生物传感器凭借其可编程性和模块化优势崭露头角。这类传感器通过特异性结合荧光团(如DFHBI-1T、TMR-DN)形成RNA-荧光复合物,其发光机制主要包括扭曲分子内电荷转移(TICT)恢复、接触淬灭(CQ)破坏和螺内酯化(SP)三种类型。
双链介导的荧光恢复是经典设计,如Spinach通过2 bp双链稳定G-四链体结构;核酶切割系统则利用锤头核酶自剪切释放FRAP模块,实现c-di-GMP检测;SELEX直接筛选可开发适配新靶点的转换模块,但耗时较长;动态结构集合导向设计通过人工RNA结构集合实现"即插即用"式传感器构建,如SSPepper-Apt平台。
动态范围(最高达130倍)、EC50(μM至nM级)和响应时间(最快2分钟)是核心参数。例如,Pepper-SAM传感器在哺乳动物细胞中实现S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的比率成像,而Broccoli-ATP传感器可监测线粒体活性变化。选择性测试需涵盖结构类似物(如SAM vs SAH),以验证特异性。
在代谢监测中,SAM-III核开关改造的传感器成功追踪细菌内SAM动态;蛋白质成像方面,MS2衣壳蛋白(MCP)标记系统实现病毒侵染实时追踪;RNA追踪技术如split-Broccoli通过互补配对激活荧光,实现β-actin mRNA成像。值得注意的是,串联多价设计(如iPepper)显著提升低丰度RNA检出率。
人工凝聚体(如CUG重复序列驱动的FLARE)将传感器局部浓度提升42.8倍;正交双色系统(如Pepper620/Broccoli)通过F30支架消除FRET干扰,实现SAM/四环素同步检测;信号放大电路(如CHARGE)催化激活数百个Broccoli单元,将检测限降至2.5 nM。
当前瓶颈包括:近红外(NIR)FRAP量子产率低(如Squash-DFQL-1T)、内源性RNA干扰、以及多通道串扰问题。深度生成设计等AI技术或将加速新型FRAP开发,而CRISPR-FRAP联用系统有望实现基因组位点动态成像。这些突破将推动该技术在肿瘤代谢、神经退行性疾病等研究中的应用。
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