土耳其猫犬源艰难梭菌全基因组分析与耐药谱研究：揭示伴侣动物作为人畜共患病潜在储库的公共卫生意义

本研究通过培养法、多位点序列分型(MLST)和牛津纳米孔长读长全基因组测序(WGS)，首次系统分析了土耳其凯塞利地区猫犬源艰难梭菌(C. difficile)的流行特征（检出率9%）、耐药谱（克林霉素耐药率33.3%、硝基咪唑耐药基因nimB检出率83.3%）及抗原特性（slpA基因77.8%、毒素基因45%）。研究发现6种序列型(ST)与人类暴发菌株高度同源，证实伴侣动物可能是多重耐药菌株的潜在储库，为"One Health"防控策略提供重要依据。

　　

Highlight

在艰难梭菌(Clostridioides difficile)流行病学转向社区相关性感染(CA-CDI)的背景下，本研究通过标准化药敏试验和全基因组测序，在"One Health"框架下揭示了伴侣动物的携带状况。

Rectal swap samples

研究材料为2023年3-7月期间从土耳其凯塞利5家宠物诊所采集的200份直肠拭子（100只猫和100只犬，每组各50份健康与腹泻样本）。采样遵循目的性抽样原则，健康动物定义为常规体检个体，腹泻动物则需满足至少48小时持续水样便的临床标准。

Phenotypic and molecular identification results

研究显示：18份样本（9%）经表型鉴定为革兰阳性、氧化酶/过氧化氢酶阴性的疑似艰难梭菌，经tpi基因PCR确认全部阳性。猫犬携带率分别为6%和12%（p>0.05），腹泻组检出率（11%）显著高于健康组（7%）（p<0.05）。值得注意的是，犬源分离株的毒素基因携带率（58.3%）显著高于猫源（16.7%）。

Discussion

在艰难梭菌流行病学格局演变的背景下，我们特别关注到：分离株对克林霉素耐药率（33.3%）与欧美报道相当，而所有菌株对万古霉素敏感。83.3%分离株携带的nimB基因可能介导硝基咪唑类耐药，这一发现对临床用药具有警示意义。系统发育分析显示ST37(17%)、ST3(11%)等型别与人类暴发菌株高度同源，暗示跨物种传播风险。

Conclusion

本研究首次揭示了土耳其伴侣动物源艰难梭菌的基因组特征：77.8%分离株携带slpA抗原基因，45%携带毒素基因，且与多国分离株存在基因重组证据。这些发现为理解该病原体在人类-动物-环境界面的传播动力学提供了关键数据，强调需加强宠物医院的感染控制措施。