美国食品动物及肉制品源非伤寒沙门菌中1类和2类整合子基因组结构特征及耐药传播机制研究

来自美国的研究人员针对整合子介导的耐药基因传播机制，通过对193株食品动物源沙门菌的全基因组测序(WGS)分析，揭示了1类整合子在多重耐药菌株中的优势分布(60.1%)及其与11类抗菌药物耐药基因(AMR)的关联，发现69种AMR基因与质粒不相容群(Inc)的共定位现象，为理解细菌适应性进化与致病性提供了新视角。

　　

这项研究深入解析了美国食品动物及肉制品源非伤寒沙门菌中整合子的基因组特征。通过全基因组测序(WGS)技术分析193株38种血清型菌株(2001-2019年分离株)，发现116株(60.1%)携带1类和/或2类整合子。其中105株仅含1类整合子(部分菌株存在多拷贝)，1株S. Infantis仅携带2类整合子，另有10株同时含有两类整合子。

研究揭示了整合子的精确定位：27个1类整合子位于染色体，其余均与质粒相关，涉及多种质粒不相容类型(Inc)。在整合子基因盒及关联质粒中鉴定出69种AMR基因，可抵抗11类抗菌药物。同时检测到季铵盐化合物耐药基因、重金属抗性基因，以及插入序列(ISs)和转座子等移动遗传元件。

值得注意的是，整合子基因盒中普遍存在关键毒力因子和应激反应相关基因，包括分子伴侣groES-groEL、转录调控因子LysR以及EAL结构域蛋白(谷氨酸-丙氨酸-亮氨酸模块)。这些发现凸显了整合子不仅介导耐药基因传播，更参与细菌环境适应和致病性调控的分子机制。

该研究为理解多重耐药(MDR)沙门菌的进化传播提供了重要证据，特别强调1类整合子通过质粒在不同菌株间的水平转移能力，对食品安全和公共卫生防控具有重要启示意义。