塞内加尔引入多替拉韦前的HIV-1遗传多样性及预处理耐药性调查:国家层面耐药监测与治疗策略优化

【字体: 时间:2025年09月06日 来源:IJID Regions 1.7

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  本研究针对塞内加尔ART-na?ve(未接受抗逆转录病毒治疗)人群,通过全国35个哨点的样本采集(2017-2018年),采用DBS(干血斑)和全血样本进行RT基因测序,发现NNRTI(非核苷类逆转录酶抑制剂)预处理耐药率(PDR)达9.2%,存在显著地域差异(东南部最高20.8%)。研究为撒哈拉以南非洲国家从EFV(依非韦伦)向DTG(多替拉韦)方案转换提供了关键耐药基线数据,发表于《IJID Regions》。

  

在撒哈拉以南非洲,抗逆转录病毒治疗(ART)虽使HIV相关死亡率下降69%,但耐药性问题日益严峻。非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI)如依非韦伦(EFV)因遗传屏障低,易产生耐药突变,而预处理耐药(PDR)会直接削弱一线治疗方案效果。塞内加尔作为西非首个1998年推广ART的国家,其CRF02_AG毒株占主导,但全国性耐药数据长期缺失。这项研究正是在多替拉韦(DTG)引入前,首次按WHO标准开展的全国耐药监测,为治疗方案迭代提供科学依据。

研究团队采用横断面调查设计,2017-2018年间在塞内加尔35个医疗点采集ART-na?ve患者样本(237例合格样本,含221份干血斑和17份全血)。通过ANRS/AC11方法对RT基因进行扩增测序,使用CPR v8.1分析耐药突变(SDRM),并结合MAFFT、PhyML等工具进行系统发育分析。样本覆盖达喀尔、中西部等五大区域,重点关注NNRTI/NRTI耐药突变的地理分布特征。

患者特征与样本质量

研究纳入患者平均年龄39岁,女性占比62%。干血斑(DBS)扩增成功率55%,全血样本达76.9%。值得注意的是,东南部地区样本基因分型成功率最高(70.6%),而中西部仅45.3%,可能与样本运输条件差异有关。

耐药突变图谱

在131例成功测序样本中,10.7%携带至少1个SDRM。NNRTI耐药率(9.2%)显著高于NRTI(4.6%),其中K103N突变占比高达91.7%(11/12),可导致EFV和奈韦拉平(NVP)完全失效。地域分析显示:东南部NNRTI耐药率惊人地达20.8%,而西南部仅3.6%;达喀尔地区则呈现NRTI/ NNRTI双重耐药热点(如患者20542同时存在D67N/K219Q和K103N/P225H突变)。

病毒进化特征

系统发育分析揭示CRF02_AG毒株占67.2%,其次为亚型C(6.9%)。发现23例独特重组形式(URF)和9个传播簇(主要存在于CRF02_AG内),但耐药突变未在传播簇中富集,提示耐药可能源于治疗压力而非传播网络。

这项研究首次绘制了塞内加尔全国HIV耐药地图,其核心价值在于:

  1. 1.

    临床决策支持:东南部超1/5的NNRTI耐药率,强力佐证了WHO建议将一线方案转为DTG的合理性;

  2. 2.

    监测方法学创新:验证了DBS在资源有限地区的适用性,尽管其55%的扩增效率仍需优化;

  3. 3.

    公共卫生警示:发现M184V(3TC/FTC耐药)和K65R(TDF潜在耐药)突变,提示需警惕新型组合方案TLD(替诺福韦/拉米夫定/多替拉韦)的潜在失效风险。

论文特别指出,由于未检测蛋白酶和整合酶基因,未来需扩展监测范围。这些发现不仅为塞内加尔2023年ART指南更新提供数据支撑,更为西非其他国家制定耐药应对策略树立了范本。随着DTG的普及,持续监测将有助于评估这一关键药物是否能在高耐药压力下维持长期有效性。

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