深度学习模拟显微镜凝集试验中的视觉评估

本研究针对食源性疾病病原体检测的难题，评估了BioFire? FilmArray? Gastrointestinal Panel (BF-GIP)在混合沙拉样本中检测Salmonella spp.和E. coli的性能。结果显示：BF-GIP对Salmonella spp.灵敏度达100%，特异性良好；对E. coli灵敏度为92.9%，但需结合参考方法确认菌株。该研究为食源性疾病暴发调查提供了高效筛查方案。

　　

食源性疾病是全球公共卫生的重要挑战，其病原体多样且症状相似，给快速诊断带来困难。传统培养方法耗时长，而分子检测技术如多重PCR（聚合酶链式反应）为疫情调查提供了新思路。法国武装部队流行病学与公共卫生中心（CESPA）的Stéphanie Watier-Grillot团队在《Journal of Microbiological Methods》发表研究，评估了BioFire? FilmArray? Gastrointestinal Panel (BF-GIP)在复杂食品基质中的检测效能，为食源性病原体筛查提供了重要数据。

研究采用ISO 16140-2标准，对205份天然/人工污染的混合沙拉样本进行检测，比较BF-GIP与培养法的性能。关键技术包括：1）BF-GIP多重PCR系统（可同时检测22种胃肠道病原体）；2）传统培养法作为参考标准；3）人工污染样本构建模型；4）灵敏度、特异性等统计学分析。

主要结果

1. 1.

   沙门氏菌检测性能：BF-GIP灵敏度达100%，假阳性率仅2.4%，表明其优异的特异性。

2. 2.

   大肠杆菌检测局限：灵敏度为92.9%，但人工接种样本的包容性（inclusivity）和排他性（exclusivity）研究显示14%和9%的误差，需参考方法辅助确认。

3. 3.

   方法学比较：BF-GIP显著缩短检测时间（仅1小时），适用于疫情应急响应，但对E. coli菌株分型需谨慎。

结论与意义

该研究证实BF-GIP是筛查Salmonella spp.的高效工具，但其对E. coli的检测需结合培养法验证。这一发现为食源性疾病暴发调查提供了“快速筛查+精准确认”的双轨策略，尤其适用于军队、航空等需快速响应的场景。未来研究可进一步优化引物设计以提高E. coli检测特异性。