丹霞调斑汤通过多组学整合与实验验证揭示抗动脉粥样硬化机制：聚焦p38 MAPK通路与核心靶点调控

本研究创新性整合多组学分析、机器学习算法与实验验证，系统阐释丹霞调斑汤（DXTB）治疗动脉粥样硬化（AS）的分子机制。首次揭示DXTB通过调控p38 MAPK信号通路及CSF1R、DPP4、MMP9等核心基因，抑制单核细胞-巨噬细胞-泡沫细胞转化，减轻血管炎症与脂质沉积，为中医药抗AS提供新靶点与临床转化依据。

　　

Highlights and limitations

本研究采用的生物信息学分析具有显著优势：首先，它能高效整合基因表达、蛋白质互作和代谢通路等大规模生物数据集，为阐明药物作用机制提供全局视角；其次，可精准预测潜在药物靶点，加速药物发现进程。然而，该技术依赖数据库完整性，且需湿实验验证预测结果的生物学意义。

Ethics statement

实验动物饲养于江西中医药大学SPF级实验室，所有操作经该校伦理委员会批准（批件号：20240312025，2024年3月13日获批）。

Funding

本研究获国家中医药优势特色专业建设项目（赣财社指[2024]39号）、国家中医药管理局高水平中医药重点学科建设项目（zyyzdxk-2023113）、江西省中医心血管病重点实验室（2024SSY06301）、国家自然科学基金（82374367）、江西省自然科学基金（20242BAB26163，20232BAB206144）支持。

CRediT authorship contribution statement

马一荣：原稿撰写、软件分析、数据整理、概念设计；胡苗：原稿撰写、概念设计；赖俊宇：文稿修订、实验实施；李家明：文稿修订、方法开发；万强：文稿修订、实验实施；孙立强：原稿撰写、数据整理；吴建光：文稿修订、项目监督、资金获取。

Declaration of competing interest

作者声明不存在任何可能不当影响研究结果的财务或个人关系。

Data availability statement

本研究数据集（GSE100927等编号）存放于GEO数据库（www.ncbi.nlm.nih.gov/geo），其他数据可根据合理要求向通讯作者获取。

Conclusion

本研究首次构建DXTB-AS"药物-成分-靶点"网络，通过LC-QQQ-MS/MS定量证实槲皮素等核心成分的体内暴露。整合pQTL与转录组数据，锁定CSF1R等6个机器学习筛选的核心基因，证实其通过p38 MAPK通路调控单核细胞活化。分子对接与SPR实验验证成分-靶点强结合力，动物实验显示DXTB显著抑制斑块形成，为中医药多靶点治疗AS提供范式。