癌症基因组图谱(TCGA)全基因组测序样本中微生物含量的深度解析与纠偏研究

微生物与癌症的关联性长期存在争议。来自多机构的研究团队通过重新分析癌症基因组图谱(TCGA)的5734个全基因组测序(WGS)数据，采用升级的计算方法和数据库，系统评估了细菌、病毒和真菌在25种癌症中的真实存在情况。研究证实既往报道中存在大量由技术误差导致的假阳性微生物信号，仅在宫颈癌和胃肠道癌症中发现有限关联。该研究不仅提供了经过严格质控的TCGA微生物数据集，更为癌症微生物组研究建立了可靠的参照标准。

　　

关于癌症组织中微生物存在情况的科学争议持续发酵。近期有大量研究声称在人类肿瘤中发现特定微生物群落，甚至提出不同癌症类型具有独特的微生物特征。然而，Ge等研究者在重新分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据时发现，技术误差导致该数据库中大量微生物物种被错误识别。

研究团队将分析范围扩展到TCGA全部5734个全基因组测序(whole-genome sequencing, WGS)数据集，涵盖25种癌症类型。通过应用更新的生物信息学分析流程和参考数据库，并与近期两项聚焦癌症微生物组的重要研究进行对比，结果再次验证了先前发现：肿瘤中实际存在的微生物数量远低于既往报道，且许多所谓"检出"的物种可能根本不存在。

特别值得注意的是，经过严格过滤可能来自环境污染的微生物序列后，仅在宫颈癌和胃肠道癌症中观察到有限的微生物关联证据。为促进领域发展，研究者公开了包含所有TCGA样本中细菌、病毒、古菌和真菌详细读长计数的数据集，这将为未来癌症微生物组研究提供重要质量对照参考。

这项研究不仅纠正了领域认知偏差，其建立的标准化分析流程和开放数据集，更有助于避免后续研究被存在缺陷的数据误导。编辑评价指出，该资源对于探索癌症微生物组的研究者具有重要参考价值。