极端嗜热古菌Pyrococcus woesei DSM 3773T全基因组解析及其与模式物种P. furiosus的进化关系

来自波特兰州立大学的研究团队完成了极端嗜热古菌Pyrococcus woesei DSM 3773T的基因组测序，通过Illumina和Nanopore混合组装获得1,856,505 bp的环状基因组（GC含量40.7%），注释出1,955个蛋白编码基因和46个tRNA。该研究为比较基因组学提供了重要数据，揭示了其与模式生物P. furiosus的进化关联。

　　

在地中海武尔卡诺岛沸腾的硫磺喷气孔深处，科学家们发现了一种神奇的微生物——沃氏火球菌(Pyrococcus woesei)。这种在85℃高温下茁壮成长的古菌，与著名的模式生物激烈火球菌(P. furiosus)有着惊人的相似性，它们的16S rRNA基因序列完全一致。

研究团队采用尖端测序技术揭开了沃氏火球菌DSM 3773^T的基因组奥秘。通过Illumina NovaSeq X Plus平台获得的高质量短读序(929,261对，2×151 bp)与Nanopore PromethION产生的长读序(N50达13,823 bp)进行混合组装，最终获得了一个完美的环状基因组。这个1.86 Mb的基因组藏着1,955个蛋白编码基因和46个tRNA，GC含量为40.7%。

有趣的是，虽然沃氏火球菌与激烈火球菌在系统发育上极为接近，但微阵列研究显示它们的基因组存在显著差异。新测序的基因组为深入比较研究提供了金标准，特别是对理解超嗜热古菌适应极端环境的分子机制具有重要意义。

这项研究不仅完善了古菌基因组数据库，更为探索生命在高温环境中的生存策略提供了新线索。从技术角度看，研究团队建立的混合组装流程(使用Unicycler软件)和严格的质量控制标准(CheckM2评估完整性达99.9%)，为微生物基因组学研究提供了优秀范例。