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【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月08日 来源:Analytica Chimica Acta 6
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针对小圆蓝细胞肿瘤(SBRCT)诊断复杂性问题,研究人员通过基质辅助激光解吸电离质谱成像(MALDI-MSI)技术,结合肽段和N-聚糖多组学数据,开发了四种机器学习分类算法,最高准确率达100%。该研究为肿瘤精准分型提供了新型分子标志物和空间多组学整合策略。
在肿瘤诊断领域,小圆蓝细胞肿瘤(SBRCT)犹如一群"伪装大师"——它们虽然共享相似的形态学特征,却可能源自完全不同的细胞谱系。这类肿瘤包括尤文肉瘤(EWS)、横纹肌肉瘤(RMS)、神经内分泌癌(NEC)等多种实体,每种类型需要截然不同的治疗方案。然而传统组织病理学诊断面临巨大挑战:当面对活检小标本时,往往需要进行数十项免疫组化检测和分子分析,既耗费珍贵样本又延长诊断周期。更棘手的是,约10-15%的病例经过全面检测仍无法明确分类。这种困境催生了德国慕尼黑工业大学Christine Bollwein团队在《Analytica Chimica Acta》发表的创新研究。
研究人员采用组织微阵列(TMA)技术整合26例SBRCT样本,通过基质辅助激光解吸电离质谱成像(MALDI-MSI)同步获取肽段和N-聚糖的空间分布信息。关键技术包括:1) 建立包含6类SBRCT的TMA样本库;2) 开发空间匹配算法实现多组学数据整合;3) 应用梯度提升(GB)、支持向量机(SVM)等四种机器学习算法进行像素级分类;4) 采用串联质谱(MS/MS)鉴定差异表达分子。
【3.1 无监督数据探索】
通过t-SNE降维分析和层次聚类发现,肽段与N-聚糖数据融合后形成更清晰的肿瘤类别簇,其中尤文肉瘤与神经母细胞瘤(NEUB)展现出独特的聚集模式。这表明多组学整合能有效增强肿瘤亚型的分子特征辨识度。
【3.2 有监督分类】
机器学习结果显示:基于N-聚糖的分类准确率(94.16%)显著高于肽段数据(87.49%)。当整合两类数据时,梯度提升算法(GB)表现最优,在"一对一"分类策略中平均准确率达96.65%,较单组学提升5.4%。特别值得注意的是,肾母细胞瘤(NEPB)与其他亚型的区分准确率接近100%,这主要归功于特异性N-聚糖标志物的发现。
【3.3 差异分子鉴定】
通过串联质谱成功鉴定出多个关键生物标志物:m/z 1143.57对应β-微管蛋白(TUBB)在神经源性肿瘤中高表达;m/z 944.48的组蛋白H2A片段在急性淋巴细胞白血病(ALL)中显著富集;而m/z 1851.89和1892.93的岩藻糖基化N-聚糖则成为肾母细胞瘤的"分子指纹"。这些分子涉及细胞骨架重构、表观遗传调控等肿瘤发生的关键通路。
这项研究开创性地证明了空间多组学整合在肿瘤诊断中的增值效应。通过将MALDI-MSI的分子成像能力与机器学习算法相结合,不仅实现了SBRCT的高精度分类,更揭示了肿瘤特异性糖基化修饰的重要诊断价值。特别值得关注的是,研究中开发的空间配准算法成功解决了系列切片间的组织变形难题,为后续多模态影像研究建立了技术标准。从临床转化角度看,该方法有望显著减少诊断所需组织量,对儿科肿瘤等小标本病例具有特殊意义。未来研究可进一步扩大样本量,并探索将这种"分子显微镜"技术整合到常规病理工作流程中。
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