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基于转录组学与实验验证的卵巢癌泛素化相关基因预后模型构建及FBXO45调控机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月09日 来源:Frontiers in Immunology 5.9
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本研究通过整合TCGA和GTEx数据库的转录组数据,结合泛素化相关基因(UBQ)筛选,构建了包含17个关键基因的卵巢癌(OV)预后模型(1/3/5年AUC=0.703-0.705),证实高风险组总体生存率显著降低(P<0.05)。研究首次揭示FBXO45作为核心E3泛素连接酶通过Wnt/β-catenin通路促进OV恶性进展,并发现低风险组具有更活跃的CD8+ T细胞和M1巨噬细胞浸润(P<0.01)。该模型为OV精准治疗提供新靶点,尤其为PROTACs药物开发奠定理论基础。
卵巢癌(OV)作为妇科恶性肿瘤死亡率之首,70%患者确诊时已进展至晚期,5年生存率仅29%。研究聚焦泛素化修饰在OV恶性进展中的关键作用,该过程通过E1-E2-E3酶级联反应调控肿瘤增殖、转移及免疫微环境(TME)。随着蛋白降解靶向嵌合体(PROTACs)技术的发展,泛素化相关基因的临床价值日益凸显。
研究整合TCGA-OV和GTEx数据库中376例肿瘤与88例正常组织转录组数据,通过差异表达分析(|logFC|≥1,p<0.01)筛选8035个差异基因(DEGs),与929个泛素化相关基因取交集获得162个关键基因。采用LASSO回归和DEVIANCE检验构建17基因预后模型,风险评分公式为:风险评分=∑(回归系数×基因表达量)。实验验证选用A2780和HEY细胞系,通过siRNA沉默FBXO45后检测增殖(CCK-8)、迁移(Transwell)及侵袭能力。
模型在训练集(TCGA)中1/3/5年AUC达0.703-0.705,高风险组总生存期显著缩短(P<0.05)。外部验证(GSE165808/GSE26712)显示一致趋势。免疫分析揭示低风险组CD8+ T细胞(P<0.05)、M1巨噬细胞(P<0.01)浸润更显著,而高风险组多见MUC17/LRRK2突变。
单细胞测序显示FBXO45与卵母细胞关联最强。临床样本中其表达与PD-L1(CD274)正相关(P<0.001)。体外实验证实沉默FBXO45可抑制OV细胞增殖(G1期阻滞)、迁移(伤口愈合速率下降50%)及侵袭(Transwell穿膜数减少60%)。
KEGG富集发现FBXO45高表达组Wnt通路激活(NES=2.196)。Western blot显示沉默FBXO45后β-catenin、WNT1和c-Myc蛋白水平显著下调。临床组织检测证实OV样本中FBXO45与WNT1共表达(P<0.01)。
研究首次系统阐明泛素化相关基因在OV预后分层中的价值,其中FBXO45通过调控Wnt/β-catenin通路驱动肿瘤进展。模型核心基因TRAF4和UBE2L3等均与已知致癌通路(如PI3K/Akt)相关。值得注意的是,FBXO45可能通过稳定PD-L1促进免疫逃逸,这为PD-1抑制剂疗效预测提供新思路。
该研究不仅建立首个OV泛素化相关预后模型,更揭示FBXO45作为治疗靶点的潜力。未来可通过开发FBXO45特异性PROTACs降解剂,或联合Wnt通路抑制剂实现精准治疗。
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