代谢-免疫-结直肠癌因果通路的多组学整合研究:SLC6A19作为ω-3脂肪酸表观遗传调控的关键靶点

【字体: 时间:2025年09月09日 来源:Frontiers in Immunology 5.9

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  这篇研究通过整合多组学数据(GWAS/EWAS/eQTL)结合功能实验,揭示了ω-3脂肪酸(FAw3byFA)通过效应记忆CD4+ T细胞(10%介导)和CpG位点(cg06817802等)调控SLC6A19表达,从而影响结直肠癌(CRC)风险的分子机制。研究发现SLC6A19在CRC中显著下调,其过表达可抑制肿瘤增殖迁移(CCK-8/Transwell实验),并与CD4+ T细胞浸润正相关,为代谢-免疫-CRC轴提供了新的治疗靶点。

  

引言

结直肠癌(CRC)作为全球第三大高发恶性肿瘤,其发病机制与代谢-免疫交互作用密切相关。近年来,ω-3多不饱和脂肪酸(PUFA)的促癌/抑癌争议备受关注。传统观点认为ω-3 PUFA具有抗炎特性,但本研究通过孟德尔随机化(MR)分析意外发现,遗传预测的高ω-3脂肪酸比例(FAw3byFA)与CRC风险正相关(OR=1.22,P=2.51×10-7),提示其作用可能具有微环境依赖性。

方法学创新

研究团队采用因果推断框架整合六层数据:

  1. 1.

    代谢组:分析233种循环代谢物与CRC的MR关联

  2. 2.

    免疫组:检测731种免疫特征(如效应记忆CD4+ T细胞绝对计数)的介导作用

  3. 3.

    表观组:通过甲基化数量性状位点(mQTL)定位ω-3相关CpG位点(如cg06817802)

  4. 4.

    转录组:融合SMR和FUMAGWAS筛选出SLC6A19等7个交叉基因

  5. 5.

    功能验证:在HCT116/SW480细胞系中通过CCK-8、伤口愈合实验验证表型

  6. 6.

    体内模型:过表达SLC6A19使裸鼠移植瘤体积减少40%(P<0.001)

关键发现

  1. 1.

    免疫介导机制:FAw3byFA通过提升效应记忆CD4+ T细胞数量(β=0.16)间接增加CRC风险,贡献率达10%

  2. 2.

    表观遗传桥梁:cg06817802位点低甲基化通过mQTL-eQTL共定位调控SLC6A19表达(PP.H4≈0.97)

  3. 3.

    靶点功能

    • SLC6A19在TCGA-COAD中表达量降低2.3倍(P<0.001)

    • 过表达使CRC细胞迁移能力下降60%(Transwell,P<0.01)

    • 与CD8+ T细胞浸润呈显著正相关(r=0.22,P=0.003)

临床意义

该研究首次揭示ω-3脂肪酸可能通过"代谢物-CpG-CD4+ T细胞-SLC6A19"轴促进CRC进展。SLC6A19作为氨基酸转运体,其表达缺失可能通过破坏肠道上皮-免疫细胞代谢对话(如谷氨酰胺/亮氨酸转运)导致免疫监视失效。这一发现为开发基于代谢重编程的CRC免疫疗法提供了新思路。

局限与展望

当前数据主要基于欧洲人群,未来需在亚洲队列中验证。此外,cg06817802甲基化动态变化与ω-3摄入量的剂量效应仍需通过纵向研究明确。团队计划在类器官模型中结合CRISPR甲基化编辑技术深入解析SLC6A19的时空调控机制。

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